More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1018 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 297 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  56.83 
 
 		 298 aa  351  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  43.73 
 
 		 282 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  44.09 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  43.88 
 
 		 282 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.27 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.06 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 		 308 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  40.41 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.19 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.86 
 
 		 285 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 		 260 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 		 260 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 		 260 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  40.22 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  40.22 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3753  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 		 299 aa  198  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  42.65 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  41.95 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  42.42 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  41.82 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  41.04 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 		 269 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 318 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  36.48 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  35.95 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.61 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0505  naphthoate synthase  34.4 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0636715  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0887  naphthoate synthase  31.5 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1897  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  33.33 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101425  normal  0.0197051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.31 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2784  naphthoate synthase  33.33 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  28 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4116  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.04 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10533  naphthoate synthase  32.92 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2567  naphthoate synthase  32.22 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.522143  normal  0.0403307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  29.1 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1707  naphthoate synthase  32.35 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1409  naphthoate synthase  32.77 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 		 256 aa  99.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.13 
 
 		 259 aa  99.8  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  30.21 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.87 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.67 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0771  naphthoate synthase  33.05 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.02 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  29.24 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  28.93 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  27.35 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0597  naphthoate synthase  31.25 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000704347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3569  naphthoate synthase  31.54 
 
 		 273 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1611  naphthoate synthase  30.9 
 
 		 277 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4674  naphthoate synthase  31.33 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  31.49 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  30.29 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  30.22 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 		 245 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0279  naphthoate synthase  29.17 
 
 		 273 aa  96.3  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.91 
 
 		 252 aa  95.9  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  29.5 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0720  2-ketocyclohexanecarboxyl-CoA hydrolase  32.07 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1542  naphthoate synthase  32.07 
 
 		 260 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.04426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.51 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  30.63 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1101  naphthoate synthase  30.21 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.648754  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 		 266 aa  94  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  28.88 
 
 		 269 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  30.91 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.09 
 
 		 248 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1616  naphthoate synthase  31.25 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.796217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0562  naphthoate synthase  30.64 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.348185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>