More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2156 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
318 aa  669    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  72.08 
 
 
308 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  71.48 
 
 
295 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.45 
 
 
283 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.64 
 
 
300 aa  397  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  66.54 
 
 
281 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  65.81 
 
 
281 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.9 
 
 
285 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3753  enoyl-CoA hydratase  60.42 
 
 
299 aa  359  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.53 
 
 
312 aa  345  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  49.03 
 
 
282 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  50.61 
 
 
282 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  48.06 
 
 
298 aa  245  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.48 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
260 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
260 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
263 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
260 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
260 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 
260 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  46.4 
 
 
302 aa  222  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 
264 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  44.18 
 
 
278 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
301 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  44.21 
 
 
269 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  42.37 
 
 
298 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 
301 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 
298 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 
298 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  37.13 
 
 
302 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
318 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
272 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
267 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
290 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 
276 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.29 
 
 
255 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.34 
 
 
273 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 
267 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
252 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  32 
 
 
259 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.14 
 
 
659 aa  112  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.76 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
273 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.04 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  31.86 
 
 
264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.67 
 
 
257 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
256 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
260 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.47 
 
 
251 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
275 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  30.17 
 
 
257 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 
269 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
253 aa  105  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.68 
 
 
264 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 
292 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 
266 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0632  naphthoate synthase  33.33 
 
 
272 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.556463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1409  naphthoate synthase  32.19 
 
 
279 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.9 
 
 
265 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.98 
 
 
265 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2567  naphthoate synthase  31.76 
 
 
279 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.522143  normal  0.0403307 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.9 
 
 
260 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
265 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0166  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.29 
 
 
249 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  29.18 
 
 
263 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 
266 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0852  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
265 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  31.74 
 
 
267 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 
266 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
302 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.97 
 
 
270 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  31.01 
 
 
297 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.9 
 
 
260 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.34 
 
 
248 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 
275 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.88 
 
 
257 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
268 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.49 
 
 
255 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.49 
 
 
255 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.49 
 
 
255 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  31.8 
 
 
272 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  28.98 
 
 
265 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.14 
 
 
263 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.74 
 
 
259 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.58 
 
 
270 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.89 
 
 
662 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.91 
 
 
258 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.55 
 
 
260 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  29.91 
 
 
261 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  26.72 
 
 
267 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2694  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
257 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  25.63 
 
 
263 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2664  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
257 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106176  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.91 
 
 
258 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.91 
 
 
258 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  29.83 
 
 
270 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>