More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0505 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0505  naphthoate synthase  100 
 
 
276 aa  576  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0636715  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10533  naphthoate synthase  90.55 
 
 
278 aa  526  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2784  naphthoate synthase  89.17 
 
 
277 aa  520  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1897  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  86.28 
 
 
280 aa  501  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101425  normal  0.0197051 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0922  naphthoate synthase  66.9 
 
 
298 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1780  naphthoate synthase  67.28 
 
 
297 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3561  naphthoate synthase  64.79 
 
 
300 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0427497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4478  naphthoate synthase  66.9 
 
 
301 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.275536  hitchhiker  0.000000359766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4358  naphthoate synthase  68.61 
 
 
301 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.612035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4340  naphthoate synthase  68.61 
 
 
301 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.197042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4886  naphthoate synthase  66.08 
 
 
301 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.896401  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6464  naphthoate synthase  66.91 
 
 
298 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4500  naphthoate synthase  68.61 
 
 
301 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2404  naphthoate synthase  66.2 
 
 
299 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4303  naphthoate synthase  68.61 
 
 
301 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.396269  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0331  naphthoate synthase  65.58 
 
 
296 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0139711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0641  naphthoate synthase  64.77 
 
 
313 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165242  hitchhiker  0.000367137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03100  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  65.95 
 
 
307 aa  367  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2150  naphthoate synthase  64.34 
 
 
303 aa  367  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6701  naphthoate synthase  66.31 
 
 
303 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0516  naphthoate synthase  64.24 
 
 
307 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0941  naphthoate synthase  63.09 
 
 
317 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.176958  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4030  naphthoate synthase  63.96 
 
 
304 aa  361  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00925917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3814  naphthoate synthase  66.3 
 
 
300 aa  360  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.327755  normal  0.0611627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3635  naphthoate synthase  66.19 
 
 
300 aa  360  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00373001  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3920  naphthoate synthase  67.77 
 
 
300 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.444654  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0395  naphthoate synthase  63.07 
 
 
299 aa  359  3e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4225  naphthoate synthase  64.41 
 
 
300 aa  359  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1084  naphthoate synthase  61.87 
 
 
321 aa  358  8e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2252  naphthoate synthase  60.26 
 
 
318 aa  358  8e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.898381  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4010  naphthoate synthase  67.03 
 
 
300 aa  357  8e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.211228  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4123  naphthoate synthase  67.03 
 
 
300 aa  357  8e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0910668  normal  0.649756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4739  naphthoate synthase  65.84 
 
 
300 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10559  naphthoate synthase  63.32 
 
 
314 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0290117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0717  naphthoate synthase  62 
 
 
308 aa  355  5e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3918  naphthoate synthase  66.67 
 
 
300 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.315175  normal  0.0248296 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0255  naphthoate synthase  63.64 
 
 
297 aa  353  1e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.732928  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0025  naphthoate synthase  62.98 
 
 
303 aa  351  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.695361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0729  naphthoate synthase  62.59 
 
 
303 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0735  naphthoate synthase  62.59 
 
 
303 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0749  naphthoate synthase  62.59 
 
 
303 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4218  naphthoate synthase  61.03 
 
 
287 aa  347  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.495316  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0947  naphthoate synthase  62.46 
 
 
307 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0024  naphthoate synthase  61.03 
 
 
287 aa  345  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0258  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  59.86 
 
 
305 aa  345  7e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0531  naphthoate synthase  58.78 
 
 
317 aa  342  4e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0787975  normal  0.016512 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24150  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  63.5 
 
 
325 aa  341  7e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0044  naphthoate synthase  58.84 
 
 
299 aa  338  4e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07300  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  59.52 
 
 
321 aa  338  8e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202295  normal  0.0739887 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06641  naphthoate synthase  58.48 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4088  naphthoate synthase  59.57 
 
 
287 aa  336  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2724  naphthoate synthase  63.6 
 
 
327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0166  naphthoate synthase  59.21 
 
 
277 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2797  naphthoate synthase  59.56 
 
 
272 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1611  naphthoate synthase  58.55 
 
 
277 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0455  naphthoate synthase  58.47 
 
 
322 aa  333  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0919  naphthoate synthase  58.7 
 
 
277 aa  332  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0597  naphthoate synthase  57.19 
 
 
279 aa  332  4e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000704347  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3283  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  58.98 
 
 
317 aa  332  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06341  naphthoate synthase  57.19 
 
 
285 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4674  naphthoate synthase  57.76 
 
 
282 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0255  naphthoate synthase  58.91 
 
 
277 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.838473  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4984  naphthoate synthase  58.52 
 
 
272 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.269846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4748  naphthoate synthase  58.52 
 
 
272 aa  328  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4586  naphthoate synthase  58.52 
 
 
272 aa  328  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0257  naphthoate synthase  58.55 
 
 
277 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5109  naphthoate synthase  58.52 
 
 
272 aa  328  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4966  naphthoate synthase  58.52 
 
 
272 aa  328  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0254  naphthoate synthase  58.52 
 
 
272 aa  328  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000397858  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3077  naphthoate synthase  58.36 
 
 
317 aa  327  9e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06731  naphthoate synthase  58.48 
 
 
285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0608  naphthoate synthase  56.12 
 
 
285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4695  naphthoate synthase  58.15 
 
 
272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5013  naphthoate synthase  57.78 
 
 
272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4608  naphthoate synthase  58.15 
 
 
272 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4995  naphthoate synthase  57.78 
 
 
272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06641  naphthoate synthase  56.47 
 
 
285 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17880  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  58.16 
 
 
323 aa  325  3e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24180  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  59.31 
 
 
331 aa  325  6e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3243  naphthoate synthase  62.92 
 
 
320 aa  325  7e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.106929 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0771  naphthoate synthase  57.72 
 
 
280 aa  324  8.000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3116  naphthoate synthase  57.25 
 
 
277 aa  322  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0805389 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1127  naphthoate synthase  57.41 
 
 
273 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0434523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1104  naphthoate synthase  57.41 
 
 
273 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3491  naphthoate synthase  57.04 
 
 
272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1123  naphthoate synthase  55.96 
 
 
289 aa  318  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.962751 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  57.78 
 
 
272 aa  318  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0632  naphthoate synthase  56.3 
 
 
272 aa  317  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.556463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0472  naphthoate synthase  56.51 
 
 
279 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1231  naphthoate synthase  54.41 
 
 
271 aa  314  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04140  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  55.15 
 
 
279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1162  naphthoate synthase  55.64 
 
 
275 aa  309  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676396 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1921  naphthoate synthase  58.46 
 
 
272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10421  naphthoate synthase  53.6 
 
 
287 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.590444  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2077  naphthoate synthase  52.94 
 
 
273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1719  naphthoate synthase  53.7 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2972  naphthoate synthase  53.68 
 
 
279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0351  naphthoate synthase  53.68 
 
 
274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621273  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18811  naphthoate synthase  51.44 
 
 
297 aa  300  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.491135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1216  naphthoate synthase  53.31 
 
 
274 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0182076  hitchhiker  0.000174974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>