More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4478 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4478  naphthoate synthase  100 
 
 		 301 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.275536  hitchhiker  0.000000359766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4886  naphthoate synthase  94.35 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.896401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4303  naphthoate synthase  90.03 
 
 		 301 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.396269  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4340  naphthoate synthase  90.03 
 
 		 301 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.197042  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4358  naphthoate synthase  90.03 
 
 		 301 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.612035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4500  naphthoate synthase  90.03 
 
 		 301 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3814  naphthoate synthase  91.36 
 
 		 300 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.327755  normal  0.0611627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4225  naphthoate synthase  90.37 
 
 		 300 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4030  naphthoate synthase  89 
 
 		 304 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00925917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3920  naphthoate synthase  88.04 
 
 		 300 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.444654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3635  naphthoate synthase  88.04 
 
 		 300 aa  555  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00373001  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4739  naphthoate synthase  86.38 
 
 		 300 aa  551  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4010  naphthoate synthase  86.38 
 
 		 300 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.211228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4123  naphthoate synthase  86.38 
 
 		 300 aa  552  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0910668  normal  0.649756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3918  naphthoate synthase  86.05 
 
 		 300 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.315175  normal  0.0248296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6464  naphthoate synthase  82.15 
 
 		 298 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6701  naphthoate synthase  77.33 
 
 		 303 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0922  naphthoate synthase  76.43 
 
 		 298 aa  476  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2404  naphthoate synthase  76.85 
 
 		 299 aa  471  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0941  naphthoate synthase  72.56 
 
 		 317 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.176958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03100  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  72.94 
 
 		 307 aa  451  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1780  naphthoate synthase  70.57 
 
 		 297 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3561  naphthoate synthase  69.23 
 
 		 300 aa  448  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0427497  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2150  naphthoate synthase  70.63 
 
 		 303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0516  naphthoate synthase  72.52 
 
 		 307 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2252  naphthoate synthase  66.46 
 
 		 318 aa  444  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.898381  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0331  naphthoate synthase  72.3 
 
 		 296 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0139711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0258  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  72.24 
 
 		 305 aa  441  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0395  naphthoate synthase  70.13 
 
 		 299 aa  438  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0025  naphthoate synthase  72.28 
 
 		 303 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.695361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0641  naphthoate synthase  70.03 
 
 		 313 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165242  hitchhiker  0.000367137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0947  naphthoate synthase  71.01 
 
 		 307 aa  427  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0729  naphthoate synthase  70.13 
 
 		 303 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0735  naphthoate synthase  70.13 
 
 		 303 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0717  naphthoate synthase  70.26 
 
 		 308 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0749  naphthoate synthase  70.13 
 
 		 303 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10559  naphthoate synthase  71.19 
 
 		 314 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0290117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17880  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  66.03 
 
 		 323 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0255  naphthoate synthase  68.03 
 
 		 297 aa  412  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.732928  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2724  naphthoate synthase  64.15 
 
 		 327 aa  408  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0455  naphthoate synthase  65.09 
 
 		 322 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0531  naphthoate synthase  63.38 
 
 		 317 aa  401  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0787975  normal  0.016512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3283  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  64.52 
 
 		 317 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1084  naphthoate synthase  65.81 
 
 		 321 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3077  naphthoate synthase  64.04 
 
 		 317 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3243  naphthoate synthase  63.69 
 
 		 320 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.106929 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24150  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  63.66 
 
 		 325 aa  393  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1897  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  68.18 
 
 		 280 aa  391  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101425  normal  0.0197051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07300  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  62.1 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202295  normal  0.0739887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24180  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  62.81 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2784  naphthoate synthase  65.26 
 
 		 277 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0505  naphthoate synthase  66.9 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0636715  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10533  naphthoate synthase  63.99 
 
 		 278 aa  368  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0608  naphthoate synthase  54.55 
 
 		 285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06641  naphthoate synthase  55.56 
 
 		 285 aa  312  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06341  naphthoate synthase  53.96 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4218  naphthoate synthase  54.24 
 
 		 287 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.495316  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0024  naphthoate synthase  53.9 
 
 		 287 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4088  naphthoate synthase  53.85 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831941 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06731  naphthoate synthase  55.76 
 
 		 285 aa  302  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231229  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4674  naphthoate synthase  54.68 
 
 		 282 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0044  naphthoate synthase  53.82 
 
 		 299 aa  299  3e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06641  naphthoate synthase  53.71 
 
 		 297 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0166  naphthoate synthase  54.32 
 
 		 277 aa  294  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0919  naphthoate synthase  53.12 
 
 		 277 aa  293  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0597  naphthoate synthase  53.15 
 
 		 279 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000704347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10421  naphthoate synthase  51.51 
 
 		 287 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.590444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0254  naphthoate synthase  54.32 
 
 		 272 aa  292  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000397858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4695  naphthoate synthase  53.96 
 
 		 272 aa  290  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1611  naphthoate synthase  53.6 
 
 		 277 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4748  naphthoate synthase  53.96 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4586  naphthoate synthase  53.96 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5109  naphthoate synthase  53.96 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4966  naphthoate synthase  53.96 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2797  naphthoate synthase  52.88 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4608  naphthoate synthase  53.6 
 
 		 272 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5013  naphthoate synthase  53.6 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4984  naphthoate synthase  53.6 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.269846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0257  naphthoate synthase  53.6 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  52.08 
 
 		 272 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4995  naphthoate synthase  53.6 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0255  naphthoate synthase  53.24 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.838473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0472  naphthoate synthase  52.3 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3116  naphthoate synthase  52.63 
 
 		 277 aa  285  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0805389 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1123  naphthoate synthase  53.24 
 
 		 289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.962751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3491  naphthoate synthase  52.52 
 
 		 272 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18811  naphthoate synthase  52.69 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.491135 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0771  naphthoate synthase  52.88 
 
 		 280 aa  281  7.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04140  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  53.07 
 
 		 279 aa  281  9e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2433  naphthoate synthase  51.8 
 
 		 273 aa  280  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1162  naphthoate synthase  52.08 
 
 		 275 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2972  naphthoate synthase  51.25 
 
 		 279 aa  278  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1231  naphthoate synthase  49.28 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2893  naphthoate synthase  51.43 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0874226  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2077  naphthoate synthase  51.08 
 
 		 273 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1719  naphthoate synthase  50.35 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2050  naphthoate synthase  50.72 
 
 		 273 aa  275  6e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1921  naphthoate synthase  51.23 
 
 		 272 aa  275  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0350  naphthoate synthase  50.17 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1333  naphthoate synthase  50.67 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0778506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>