More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0255 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0255  naphthoate synthase  100 
 
 
297 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.732928  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0331  naphthoate synthase  70.51 
 
 
296 aa  424  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0139711  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2404  naphthoate synthase  72.2 
 
 
299 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6701  naphthoate synthase  70.85 
 
 
303 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4886  naphthoate synthase  67.69 
 
 
301 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.896401  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4340  naphthoate synthase  68.03 
 
 
301 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.197042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4500  naphthoate synthase  68.03 
 
 
301 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4358  naphthoate synthase  68.03 
 
 
301 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.612035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4478  naphthoate synthase  68.03 
 
 
301 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.275536  hitchhiker  0.000000359766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4303  naphthoate synthase  68.03 
 
 
301 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.396269  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03100  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  69.57 
 
 
307 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0516  naphthoate synthase  67.89 
 
 
307 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6464  naphthoate synthase  69.05 
 
 
298 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0922  naphthoate synthase  69.73 
 
 
298 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0941  naphthoate synthase  67.1 
 
 
317 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.176958  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0641  naphthoate synthase  68.09 
 
 
313 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165242  hitchhiker  0.000367137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0025  naphthoate synthase  69.18 
 
 
303 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.695361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4739  naphthoate synthase  65.99 
 
 
300 aa  394  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3920  naphthoate synthase  66.33 
 
 
300 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.444654  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4010  naphthoate synthase  65.99 
 
 
300 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.211228  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4030  naphthoate synthase  64.21 
 
 
304 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00925917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4123  naphthoate synthase  65.99 
 
 
300 aa  394  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0910668  normal  0.649756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3814  naphthoate synthase  65.32 
 
 
300 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.327755  normal  0.0611627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4225  naphthoate synthase  64.97 
 
 
300 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3918  naphthoate synthase  65.65 
 
 
300 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.315175  normal  0.0248296 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0395  naphthoate synthase  66.44 
 
 
299 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1780  naphthoate synthase  66.21 
 
 
297 aa  391  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3561  naphthoate synthase  63.85 
 
 
300 aa  387  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0427497  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2252  naphthoate synthase  62.1 
 
 
318 aa  389  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.898381  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0735  naphthoate synthase  66.78 
 
 
303 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0729  naphthoate synthase  66.78 
 
 
303 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3635  naphthoate synthase  66.55 
 
 
300 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00373001  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0749  naphthoate synthase  66.78 
 
 
303 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0947  naphthoate synthase  68.58 
 
 
307 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0717  naphthoate synthase  64.47 
 
 
308 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0531  naphthoate synthase  64.63 
 
 
317 aa  385  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0787975  normal  0.016512 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10559  naphthoate synthase  67.12 
 
 
314 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0290117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2724  naphthoate synthase  64.13 
 
 
327 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1084  naphthoate synthase  65.8 
 
 
321 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0258  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  64.03 
 
 
305 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2150  naphthoate synthase  64.45 
 
 
303 aa  383  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17880  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  63.75 
 
 
323 aa  375  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24150  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  63.12 
 
 
325 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07300  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  61.59 
 
 
321 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202295  normal  0.0739887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0455  naphthoate synthase  62.42 
 
 
322 aa  371  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3243  naphthoate synthase  63.99 
 
 
320 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.106929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24180  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  62.07 
 
 
331 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3077  naphthoate synthase  63.43 
 
 
317 aa  368  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3283  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  61.29 
 
 
317 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1897  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  62.86 
 
 
280 aa  358  7e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101425  normal  0.0197051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0505  naphthoate synthase  63.64 
 
 
276 aa  353  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0636715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2784  naphthoate synthase  63.1 
 
 
277 aa  353  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10533  naphthoate synthase  61.57 
 
 
278 aa  347  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4218  naphthoate synthase  52.25 
 
 
287 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.495316  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0024  naphthoate synthase  52.25 
 
 
287 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06641  naphthoate synthase  51.43 
 
 
285 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0608  naphthoate synthase  50.71 
 
 
285 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06341  naphthoate synthase  51.85 
 
 
285 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0597  naphthoate synthase  53.02 
 
 
279 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000704347  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10421  naphthoate synthase  52.65 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.590444  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06731  naphthoate synthase  52.59 
 
 
285 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4088  naphthoate synthase  51.96 
 
 
287 aa  271  7e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0166  naphthoate synthase  51.6 
 
 
277 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2433  naphthoate synthase  53.31 
 
 
273 aa  269  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4674  naphthoate synthase  51.25 
 
 
282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1611  naphthoate synthase  50.53 
 
 
277 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0919  naphthoate synthase  49.82 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2077  naphthoate synthase  50.72 
 
 
273 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0255  naphthoate synthase  50 
 
 
277 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.838473  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2050  naphthoate synthase  51.61 
 
 
273 aa  265  7e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0350  naphthoate synthase  50.18 
 
 
280 aa  265  7e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0257  naphthoate synthase  49.65 
 
 
277 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06641  naphthoate synthase  50.92 
 
 
297 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1719  naphthoate synthase  52.96 
 
 
273 aa  264  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1559  naphthoate synthase  50.88 
 
 
296 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0044  naphthoate synthase  50.92 
 
 
299 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1129  naphthoate synthase  51.67 
 
 
283 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1880  naphthoate synthase  49.64 
 
 
273 aa  263  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2091  naphthoate synthase  51.25 
 
 
273 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0351  naphthoate synthase  52.57 
 
 
274 aa  262  4e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621273  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0328  naphthoate synthase  51.85 
 
 
273 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0113118 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1123  naphthoate synthase  51.96 
 
 
289 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.962751 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0562  naphthoate synthase  50.18 
 
 
278 aa  261  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.348185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1753  naphthoate synthase  49.1 
 
 
274 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2812  naphthoate synthase  48.64 
 
 
285 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  50.9 
 
 
272 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2651  naphthoate synthase  50.18 
 
 
285 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0194594  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18811  naphthoate synthase  51.59 
 
 
297 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.491135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2443  naphthoate synthase  50.18 
 
 
285 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00319008  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2547  naphthoate synthase  50.18 
 
 
285 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0659643  normal  0.90285 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2492  naphthoate synthase  50.18 
 
 
285 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0682871  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2535  naphthoate synthase  50.18 
 
 
285 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1047  naphthoate synthase  49.65 
 
 
285 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3012  naphthoate synthase  49.3 
 
 
285 aa  259  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1113  naphthoate synthase  49.65 
 
 
285 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.04669  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3201  naphthoate synthase  49.65 
 
 
285 aa  258  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.354537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2641  naphthoate synthase  49.66 
 
 
285 aa  258  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0549991  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3404  naphthoate synthase  49.66 
 
 
285 aa  258  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298382  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1395  naphthoate synthase  49.32 
 
 
285 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1386  naphthoate synthase  49.32 
 
 
285 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>