More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3918 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3918  naphthoate synthase  100 
 
 		 300 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.315175  normal  0.0248296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4010  naphthoate synthase  99.67 
 
 		 300 aa  624  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.211228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4123  naphthoate synthase  99.67 
 
 		 300 aa  624  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0910668  normal  0.649756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4739  naphthoate synthase  97.33 
 
 		 300 aa  614  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3920  naphthoate synthase  97 
 
 		 300 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.444654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4303  naphthoate synthase  94.02 
 
 		 301 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.396269  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4340  naphthoate synthase  94.02 
 
 		 301 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.197042  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4358  naphthoate synthase  94.02 
 
 		 301 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.612035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4500  naphthoate synthase  94.02 
 
 		 301 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4030  naphthoate synthase  89.6 
 
 		 304 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00925917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3635  naphthoate synthase  90.33 
 
 		 300 aa  567  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00373001  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3814  naphthoate synthase  89.33 
 
 		 300 aa  564  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.327755  normal  0.0611627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4225  naphthoate synthase  88 
 
 		 300 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4886  naphthoate synthase  86.38 
 
 		 301 aa  552  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.896401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4478  naphthoate synthase  86.05 
 
 		 301 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.275536  hitchhiker  0.000000359766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6464  naphthoate synthase  77.1 
 
 		 298 aa  472  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0922  naphthoate synthase  75.08 
 
 		 298 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2404  naphthoate synthase  72.15 
 
 		 299 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6701  naphthoate synthase  72.48 
 
 		 303 aa  435  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1780  naphthoate synthase  70.9 
 
 		 297 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0941  naphthoate synthase  68.14 
 
 		 317 aa  427  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.176958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3561  naphthoate synthase  68.67 
 
 		 300 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0427497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0258  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  69.23 
 
 		 305 aa  424  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03100  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  70.2 
 
 		 307 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2150  naphthoate synthase  69.64 
 
 		 303 aa  423  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0516  naphthoate synthase  69.87 
 
 		 307 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2252  naphthoate synthase  64.35 
 
 		 318 aa  413  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.898381  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0331  naphthoate synthase  67.57 
 
 		 296 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0139711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0395  naphthoate synthase  67.11 
 
 		 299 aa  408  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0641  naphthoate synthase  68.08 
 
 		 313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165242  hitchhiker  0.000367137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0025  naphthoate synthase  68.32 
 
 		 303 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.695361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0947  naphthoate synthase  67.1 
 
 		 307 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0735  naphthoate synthase  66.78 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0729  naphthoate synthase  66.78 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0749  naphthoate synthase  66.78 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0255  naphthoate synthase  65.65 
 
 		 297 aa  391  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.732928  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0717  naphthoate synthase  66.01 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17880  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  63.46 
 
 		 323 aa  386  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2724  naphthoate synthase  61.78 
 
 		 327 aa  381  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10559  naphthoate synthase  66.1 
 
 		 314 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0290117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1084  naphthoate synthase  62.07 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3243  naphthoate synthase  60.83 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.106929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0455  naphthoate synthase  61.18 
 
 		 322 aa  371  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3077  naphthoate synthase  61.66 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3283  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  62.46 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1897  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  67.63 
 
 		 280 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101425  normal  0.0197051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07300  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  58.49 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202295  normal  0.0739887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2784  naphthoate synthase  64.21 
 
 		 277 aa  364  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24150  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  59.94 
 
 		 325 aa  364  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24180  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  61.56 
 
 		 331 aa  362  4e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0531  naphthoate synthase  58.28 
 
 		 317 aa  360  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0787975  normal  0.016512 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0505  naphthoate synthase  66.67 
 
 		 276 aa  354  7.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0636715  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10533  naphthoate synthase  64.41 
 
 		 278 aa  353  2e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06641  naphthoate synthase  51.75 
 
 		 285 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06341  naphthoate synthase  51.58 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0608  naphthoate synthase  51.8 
 
 		 285 aa  292  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4218  naphthoate synthase  52.2 
 
 		 287 aa  288  9e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.495316  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4088  naphthoate synthase  52.28 
 
 		 287 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0024  naphthoate synthase  51.01 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4674  naphthoate synthase  52.52 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0597  naphthoate synthase  52.28 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000704347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0166  naphthoate synthase  52.16 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06731  naphthoate synthase  51.44 
 
 		 285 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231229  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0919  naphthoate synthase  50.88 
 
 		 277 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10421  naphthoate synthase  51.8 
 
 		 287 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.590444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1611  naphthoate synthase  51.08 
 
 		 277 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424236 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0044  naphthoate synthase  49.29 
 
 		 299 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0255  naphthoate synthase  50.36 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.838473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3116  naphthoate synthase  51.06 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0805389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0257  naphthoate synthase  50 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06641  naphthoate synthase  49.29 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0254  naphthoate synthase  51.62 
 
 		 272 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000397858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2797  naphthoate synthase  50.72 
 
 		 272 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4695  naphthoate synthase  51.26 
 
 		 272 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4748  naphthoate synthase  51.26 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4586  naphthoate synthase  51.26 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  49.83 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5109  naphthoate synthase  51.26 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4966  naphthoate synthase  51.26 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4608  naphthoate synthase  50.9 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2433  naphthoate synthase  50.54 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0472  naphthoate synthase  50.88 
 
 		 279 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5013  naphthoate synthase  50.9 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4995  naphthoate synthase  50.9 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4984  naphthoate synthase  50.9 
 
 		 272 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.269846  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1123  naphthoate synthase  50.72 
 
 		 289 aa  266  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.962751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3491  naphthoate synthase  50.54 
 
 		 272 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2050  naphthoate synthase  50.72 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0350  naphthoate synthase  49.83 
 
 		 280 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18811  naphthoate synthase  49.64 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.491135 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1719  naphthoate synthase  49.47 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2077  naphthoate synthase  50.54 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0771  naphthoate synthase  50.36 
 
 		 280 aa  262  4e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2091  naphthoate synthase  50 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1921  naphthoate synthase  50.7 
 
 		 272 aa  262  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04140  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  51.8 
 
 		 279 aa  261  8.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1880  naphthoate synthase  49.28 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1162  naphthoate synthase  49.83 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676396 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1231  naphthoate synthase  47.83 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0328  naphthoate synthase  50 
 
 		 273 aa  259  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0113118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>