More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0841 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 		 267 aa  315  7e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 		 281 aa  218  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  47.46 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  47.46 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  47.46 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  46.61 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.14 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  51.75 
 
 		 264 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  46.19 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  44.22 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.63 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  41.79 
 
 		 282 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  42.09 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  46.26 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  41.07 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.65 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  42.35 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  41.39 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  43.09 
 
 		 298 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  43.09 
 
 		 298 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  43.09 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  44.63 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  42.13 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.1 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3753  enoyl-CoA hydratase  38.8 
 
 		 299 aa  158  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  38.82 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.17 
 
 		 275 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 		 260 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  36.77 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 		 269 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  41.12 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.4 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.38 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 		 264 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.42 
 
 		 659 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.5 
 
 		 251 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.33 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3586  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.59 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.383471  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0321  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317267  normal  0.269459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  39.2 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.67 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  40.72 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17860  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.88 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213095  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  40.72 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.28 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.36 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2902  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.48 
 
 		 650 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  29.62 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  35.9 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  35.9 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  38.39 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5908  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.65 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>