More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2705 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
262 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3818  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.82 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3892  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.82 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3804  enoyl-CoA hydratase  50.41 
 
 
255 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726553  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.79 
 
 
269 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6922  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.61 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.74 
 
 
254 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4253  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.38 
 
 
254 aa  215  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.57 
 
 
258 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.57 
 
 
258 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.57 
 
 
258 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.52 
 
 
264 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.03 
 
 
264 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.74 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
262 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
262 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  39.03 
 
 
266 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.24 
 
 
269 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2750  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.75 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 
268 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7280  enoyl-CoA hydratase  40.65 
 
 
281 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 
267 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  38.89 
 
 
279 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 
263 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
275 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  37.95 
 
 
269 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  37.61 
 
 
275 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0080  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
275 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  37.18 
 
 
295 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.53 
 
 
264 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
269 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 
275 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
286 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 
275 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  39.41 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 
275 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  35.81 
 
 
272 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
272 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  39.41 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  39.41 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  39.41 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  39.41 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
257 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0363  enoyl-CoA hydratase  39.41 
 
 
249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0110  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
277 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0439  enoyl-CoA hydratase  38.92 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0603  enoyl-CoA hydratase  38.92 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  41.35 
 
 
267 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3993  enoyl-CoA hydratase  41.4 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169816  normal  0.366348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0287  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.86 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921872  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0484  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.056437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.25 
 
 
267 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4233  enoyl-CoA hydratase  34.19 
 
 
295 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  36.32 
 
 
258 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
257 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
265 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
268 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 
264 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
266 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
265 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
258 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.48 
 
 
259 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
270 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
264 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.56 
 
 
260 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  35.47 
 
 
258 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.63 
 
 
260 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
258 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  34.71 
 
 
260 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  34.71 
 
 
260 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
258 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
258 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
258 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
258 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
258 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
264 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  35.47 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  38.33 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>