More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1840 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.52 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.65 
 
 		 269 aa  262  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.97 
 
 		 267 aa  254  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 		 268 aa  244  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.95 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.58 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  39.1 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.19 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  36.54 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 267 aa  168  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.7 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.39 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3892  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3818  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4253  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.93 
 
 		 254 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3804  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726553  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6922  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7280  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.71 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.7 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 		 273 aa  148  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.65 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.02 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 272 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0110  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.42 
 
 		 260 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.45 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.03 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.83 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  40.65 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.83 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.82 
 
 		 662 aa  139  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>