More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1991 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.42 
 
 
269 aa  240  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 
268 aa  238  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.05 
 
 
267 aa  234  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.36 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.95 
 
 
264 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
262 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
262 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.47 
 
 
263 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 
267 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  35.98 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
269 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 
266 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2750  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
268 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
273 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
262 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7280  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
272 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
276 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
269 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
262 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
275 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
275 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.89 
 
 
264 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
275 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
275 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0439  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
275 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0603  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
326 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
263 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
275 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
269 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
275 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0110  enoyl-CoA hydratase  32.7 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
295 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 
265 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
263 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
263 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.53 
 
 
262 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4233  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
295 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
266 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0484  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
295 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.056437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0080  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  32.45 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4253  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
268 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
259 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3643  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0363  enoyl-CoA hydratase  35.81 
 
 
249 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3804  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726553  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
263 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
263 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
263 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
263 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
263 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
266 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
263 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
263 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.03 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3993  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
260 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169816  normal  0.366348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6922  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 
258 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3892  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
255 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3818  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
255 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
265 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 
269 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 
260 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
257 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
266 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
262 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
263 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  30.86 
 
 
261 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
256 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
257 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.47 
 
 
263 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
271 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.8 
 
 
659 aa  122  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0287  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
270 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921872  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 
258 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 
257 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
258 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
259 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.81 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  29.77 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>