More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0515 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
266 aa  544  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 
267 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
264 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 
269 aa  217  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.94 
 
 
268 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
263 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  38.49 
 
 
279 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.1 
 
 
264 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.03 
 
 
262 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  36.98 
 
 
273 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2750  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.17 
 
 
268 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7280  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
281 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
264 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0110  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0080  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
275 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
295 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 
272 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
275 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
275 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
272 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
275 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0484  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
295 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.056437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
272 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 
275 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4233  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
295 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.68 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
275 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
275 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
276 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
275 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
275 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
275 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0363  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
249 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0439  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
275 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0603  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
326 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3993  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
260 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169816  normal  0.366348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
662 aa  139  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.07 
 
 
662 aa  138  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.48 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
260 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
258 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.34 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.23 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.18 
 
 
662 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
260 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.64 
 
 
258 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.06 
 
 
661 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
263 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  34.26 
 
 
663 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.47 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
263 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.59 
 
 
260 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
260 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
258 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11165  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.192459 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.9 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.92 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0287  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921872  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.82 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.51 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.21 
 
 
263 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
263 aa  126  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
263 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.39 
 
 
260 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
255 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
267 aa  125  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  35.75 
 
 
269 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4253  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
254 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
258 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  34.72 
 
 
265 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
251 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
264 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
263 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
261 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
259 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
268 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>