More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0287 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0287  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
270 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921872  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7280  enoyl-CoA hydratase  58.11 
 
 
281 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2750  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.73 
 
 
268 aa  308  5.9999999999999995e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.94 
 
 
269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  52.59 
 
 
286 aa  291  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  54.44 
 
 
273 aa  288  6e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  52.65 
 
 
295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4233  enoyl-CoA hydratase  53.61 
 
 
295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0484  enoyl-CoA hydratase  53.23 
 
 
295 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.056437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0080  enoyl-CoA hydratase  57.69 
 
 
275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3993  enoyl-CoA hydratase  56.64 
 
 
260 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169816  normal  0.366348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0110  enoyl-CoA hydratase  57.08 
 
 
277 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
275 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  52.27 
 
 
275 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  52.27 
 
 
275 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  52.27 
 
 
275 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
275 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
275 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
275 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
275 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  52.27 
 
 
275 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  51.48 
 
 
275 aa  278  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  51.89 
 
 
275 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  52.43 
 
 
272 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  52.43 
 
 
272 aa  275  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0439  enoyl-CoA hydratase  49.44 
 
 
275 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0603  enoyl-CoA hydratase  49.44 
 
 
326 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0363  enoyl-CoA hydratase  56.64 
 
 
249 aa  275  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  53.99 
 
 
276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  55.79 
 
 
272 aa  270  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  51.91 
 
 
269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3643  enoyl-CoA hydratase  55.37 
 
 
265 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.19 
 
 
266 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959548  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.75 
 
 
269 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
269 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
262 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
262 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
262 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 
268 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
263 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.86 
 
 
262 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
266 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
264 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  31.56 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
257 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  32.78 
 
 
258 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  32.78 
 
 
258 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.43 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
258 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  32.64 
 
 
258 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  32.64 
 
 
258 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  32.64 
 
 
258 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  32.64 
 
 
258 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
260 aa  115  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6922  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
263 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
254 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30.89 
 
 
262 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4253  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
270 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  30.83 
 
 
263 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.2 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
260 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 
268 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 
257 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.4 
 
 
259 aa  108  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.66 
 
 
661 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.78 
 
 
663 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
279 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
264 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 
258 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.09 
 
 
266 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 
260 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0290  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 
267 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926213  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
263 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.27 
 
 
273 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
273 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
264 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 
265 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
262 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>