More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0321 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 
266 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.17 
 
 
268 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
262 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
262 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
262 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
269 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 
267 aa  178  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
269 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.84 
 
 
263 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
267 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
258 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
260 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
264 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7280  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
260 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 
268 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
269 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 
266 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
269 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
265 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  29.85 
 
 
273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 
265 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
264 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
263 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
267 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  33.99 
 
 
266 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 
262 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.77 
 
 
260 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
262 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
262 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 
276 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
260 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  32.25 
 
 
295 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  32.25 
 
 
275 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 
264 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
253 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  32.25 
 
 
275 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
264 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  37.18 
 
 
262 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  32.25 
 
 
275 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
268 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 
275 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.2 
 
 
661 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
260 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  31.51 
 
 
272 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.4 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4233  enoyl-CoA hydratase  30.07 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  31.09 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 
275 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
260 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
258 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2750  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0484  enoyl-CoA hydratase  29.71 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.056437 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
262 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
262 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6922  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
258 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
262 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 
262 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
272 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
275 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
275 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
265 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.18 
 
 
269 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
275 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
275 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
257 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 
257 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 
268 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.08 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0439  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
275 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>