More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2823 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 275 aa  553  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  99.27 
 
 		 275 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  96.73 
 
 		 295 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  97.82 
 
 		 275 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  96.73 
 
 		 275 aa  540  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  97.82 
 
 		 275 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  97.82 
 
 		 275 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  87.59 
 
 		 275 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  87.23 
 
 		 275 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  87.23 
 
 		 275 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  87.23 
 
 		 275 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  87.23 
 
 		 275 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0603  enoyl-CoA hydratase  86.86 
 
 		 326 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0439  enoyl-CoA hydratase  86.86 
 
 		 275 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  85.61 
 
 		 286 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4233  enoyl-CoA hydratase  84.87 
 
 		 295 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0484  enoyl-CoA hydratase  83.76 
 
 		 295 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.056437 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0363  enoyl-CoA hydratase  90.32 
 
 		 249 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0110  enoyl-CoA hydratase  77.65 
 
 		 277 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0080  enoyl-CoA hydratase  77.39 
 
 		 275 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  76.23 
 
 		 272 aa  407  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  76.03 
 
 		 272 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  76.78 
 
 		 272 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3643  enoyl-CoA hydratase  73.96 
 
 		 265 aa  362  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  63.64 
 
 		 273 aa  356  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2750  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.65 
 
 		 268 aa  343  1e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7280  enoyl-CoA hydratase  62.45 
 
 		 281 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.15 
 
 		 269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  61.42 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3993  enoyl-CoA hydratase  64.62 
 
 		 260 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169816  normal  0.366348 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  53.76 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  51.5 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0287  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.48 
 
 		 270 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.36 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 		 264 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 		 269 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.61 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  31.52 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.33 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.33 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4253  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.74 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.53 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6922  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3892  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3818  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3804  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726553  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.45 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.54 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3339  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.63 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  29.64 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  30.33 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  30.57 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 		 266 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  34.42 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.49 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  30.15 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.87 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  29.28 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.78 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  29.54 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  29.29 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.89 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.585448  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.21 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.63 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.71 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.15 
 
 		 659 aa  97.8  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.38 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.75 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  30.51 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.46 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  29.1 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  30.7 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  30.51 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.22 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  31.9 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>