More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0484 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0484  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
295 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.056437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4233  enoyl-CoA hydratase  95.93 
 
 
295 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  89.3 
 
 
286 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  83.88 
 
 
275 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  83.39 
 
 
295 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  84.13 
 
 
275 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  83.76 
 
 
275 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  83.39 
 
 
275 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  83.76 
 
 
275 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  83.76 
 
 
275 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  80.37 
 
 
275 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  80.74 
 
 
275 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  80.37 
 
 
275 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  80.37 
 
 
275 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  80.37 
 
 
275 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0439  enoyl-CoA hydratase  80 
 
 
275 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0603  enoyl-CoA hydratase  80 
 
 
326 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0363  enoyl-CoA hydratase  83.06 
 
 
249 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0110  enoyl-CoA hydratase  78.71 
 
 
277 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0080  enoyl-CoA hydratase  79.01 
 
 
275 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  75.94 
 
 
272 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  75.19 
 
 
272 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  74.81 
 
 
272 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3643  enoyl-CoA hydratase  72.93 
 
 
265 aa  362  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7280  enoyl-CoA hydratase  61.68 
 
 
281 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  63.46 
 
 
273 aa  345  6e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.51 
 
 
269 aa  341  8e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2750  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.3 
 
 
268 aa  341  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  59.93 
 
 
276 aa  318  5e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3993  enoyl-CoA hydratase  62.84 
 
 
260 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169816  normal  0.366348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  51.31 
 
 
269 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  52.06 
 
 
267 aa  278  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0287  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.23 
 
 
270 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921872  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.8 
 
 
266 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959548  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
262 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
269 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 
263 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 
262 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 
262 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.39 
 
 
269 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
266 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
268 aa  148  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
264 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  29.71 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
262 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 
258 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4253  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.87 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 
254 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3892  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3818  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3804  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726553  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6922  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.17 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  31.03 
 
 
268 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3339  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.76 
 
 
253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 
263 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
264 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 
254 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  32.78 
 
 
265 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.38 
 
 
257 aa  105  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 
266 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  32.78 
 
 
263 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  35.35 
 
 
276 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  29.28 
 
 
257 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  31.33 
 
 
260 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
262 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.07 
 
 
258 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
263 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.02 
 
 
266 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 
260 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.91 
 
 
267 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.75 
 
 
264 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.81 
 
 
264 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.82 
 
 
263 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  29 
 
 
261 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
263 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.89 
 
 
269 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
269 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.67 
 
 
262 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
263 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.42 
 
 
248 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.585448  normal  0.660482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.58 
 
 
663 aa  99.4  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
275 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  30.47 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
262 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>