More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1938 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
271 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.54 
 
 
273 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.01 
 
 
273 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.33 
 
 
260 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 
275 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 
281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 
281 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.07 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.98 
 
 
663 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.84 
 
 
259 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.16 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1216  naphthoate synthase  34.75 
 
 
274 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0182076  hitchhiker  0.000174974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
261 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
261 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1753  naphthoate synthase  33.98 
 
 
274 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 
283 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  33.18 
 
 
260 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
261 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.35 
 
 
663 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
263 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  33.92 
 
 
260 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
272 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 
260 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
265 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 
292 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 
267 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
260 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
260 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0225  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  34.38 
 
 
277 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000072879  normal  0.0457415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.27 
 
 
661 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  35.64 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  33.46 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1409  naphthoate synthase  33.33 
 
 
279 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2797  naphthoate synthase  37.16 
 
 
272 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.51 
 
 
260 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4984  naphthoate synthase  36.53 
 
 
272 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.269846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4748  naphthoate synthase  36.53 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4586  naphthoate synthase  36.53 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4966  naphthoate synthase  36.53 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5109  naphthoate synthase  36.53 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.21 
 
 
659 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.58 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.51 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.63 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0254  naphthoate synthase  36.53 
 
 
272 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000397858  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4608  naphthoate synthase  36.07 
 
 
272 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0321  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 
287 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317267  normal  0.269459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3358  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  34.36 
 
 
276 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2400  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  34.36 
 
 
276 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5013  naphthoate synthase  36.07 
 
 
272 aa  118  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.86 
 
 
251 aa  118  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4995  naphthoate synthase  36.07 
 
 
272 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1523  naphthoate synthase  35.62 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4695  naphthoate synthase  36.07 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
312 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  33.03 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.53 
 
 
662 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.75 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.75 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2047  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  33.48 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3210  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  33.19 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.324324  normal  0.0213187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4005  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 
300 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3491  naphthoate synthase  35.16 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.88 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5505  enoyl-CoA hydratase  30.34 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4870  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  33.04 
 
 
277 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00246591  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
278 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0632  naphthoate synthase  35.78 
 
 
272 aa  115  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.556463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
254 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1707  naphthoate synthase  32.81 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  32.6 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  32.6 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2077  naphthoate synthase  32.8 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 
265 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  30.96 
 
 
302 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1129  naphthoate synthase  33.33 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  33.93 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0350  naphthoate synthase  33.74 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.24 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.04 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>