More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0341 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  59.32 
 
 		 297 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5505  enoyl-CoA hydratase  50.17 
 
 		 293 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  37.68 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2696  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 		 312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 		 280 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0976  enoyl-CoA hydratase  35.62 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0994  enoyl-CoA hydratase  35.62 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1004  enoyl-CoA hydratase  35.62 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1270  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00698519  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10687  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4282  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.89 
 
 		 328 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4005  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2706  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.22 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.86 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0606  enoyl-CoA hydratase  30.99 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0557731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0615  enoyl-CoA hydratase  30.99 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0628  enoyl-CoA hydratase  30.99 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0321  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317267  normal  0.269459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0780  enoyl-CoA hydratase  28.87 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0927737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10462  enoyl-CoA hydratase  28.72 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.96 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  29.29 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.36 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  29.62 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.73 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.77 
 
 		 312 aa  109  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  31.36 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  30.96 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  30.93 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.4 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.47 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.19 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.24 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.54 
 
 		 662 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 		 260 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 		 260 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 		 318 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 		 260 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  34.19 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.68 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  34.04 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4357  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.87 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.661723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.33 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.18 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  31.14 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  29.74 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.94 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.7 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.66 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1464  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.89 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.710715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  28.45 
 
 		 260 aa  99.4  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  29.31 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  29.31 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.27 
 
 		 260 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.17 
 
 		 662 aa  99  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  33.17 
 
 		 288 aa  99  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 264 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5465  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  31.07 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  33.91 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4916  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  31.07 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>