More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0321 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0321  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
287 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317267  normal  0.269459 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1464  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.27 
 
 
279 aa  329  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.710715  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0518  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.36 
 
 
280 aa  258  6e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
309 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4005  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 
292 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2696  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.39 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
280 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
273 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.15 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5505  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 
297 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10462  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
304 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
302 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 
271 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0780  enoyl-CoA hydratase  27.34 
 
 
300 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0927737  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2706  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.73 
 
 
296 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4282  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.49 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  32.1 
 
 
260 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1270  enoyl-CoA hydratase  29.71 
 
 
302 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00698519  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0615  enoyl-CoA hydratase  28.3 
 
 
300 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0606  enoyl-CoA hydratase  28.3 
 
 
300 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0557731  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0628  enoyl-CoA hydratase  28.3 
 
 
300 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756527  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
264 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.89 
 
 
259 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1004  enoyl-CoA hydratase  30.22 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 
263 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0976  enoyl-CoA hydratase  30.22 
 
 
312 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0994  enoyl-CoA hydratase  30.22 
 
 
312 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.22 
 
 
659 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.59 
 
 
272 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10687  enoyl-CoA hydratase  30.22 
 
 
312 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
281 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 
302 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
300 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 
263 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 
263 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 
281 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.51 
 
 
312 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.51 
 
 
268 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  33.61 
 
 
267 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0225  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  28.94 
 
 
277 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000072879  normal  0.0457415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
260 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
260 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.49 
 
 
260 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
260 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.12 
 
 
257 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
269 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 
258 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  33.33 
 
 
663 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.53 
 
 
283 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  28.15 
 
 
258 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.41 
 
 
264 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.32 
 
 
259 aa  99  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 
255 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3358  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  27.7 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2944  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  28.42 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2400  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  27.7 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14230  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  27.94 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0814417  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2728  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  28.42 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0237871  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  27.16 
 
 
663 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0278  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  26.71 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179195  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  31.53 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0897  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.87 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  26.6 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0879  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
258 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.09 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 
282 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  32.76 
 
 
269 aa  95.5  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.7 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.19 
 
 
661 aa  94.7  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
265 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2758  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  29.65 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154422  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3210  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  27.37 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.324324  normal  0.0213187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
257 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3478  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  29.37 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0451778  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  29.51 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2930  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
264 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  28.44 
 
 
662 aa  94  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1299  dihydroxynaphthoic acid synthase  28.92 
 
 
270 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.549258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0110  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.47 
 
 
263 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.549312  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.66 
 
 
662 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2361  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  28.9 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1067  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  28.9 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2047  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  26.98 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1802  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  28.9 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>