More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5093 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  58.4 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3111  enoyl-CoA hydratase  57.54 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554974  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0605  enoyl-CoA hydratase  57.54 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1561  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.52 
 
 		 258 aa  288  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  56.73 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1988  enoyl-CoA hydratase  55.25 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4402  enoyl-CoA hydratase  56.22 
 
 		 257 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3578  enoyl-CoA hydratase  54.69 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0354874  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0274  enoyl-CoA hydratase  56.85 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00265078  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0923  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  49 
 
 		 282 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.18 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.98 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  45.75 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2366  enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 		 289 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000255309  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 		 261 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2560  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 		 268 aa  211  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 		 263 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4798  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  34.52 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.52 
 
 		 659 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 		 259 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.77 
 
 		 662 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.38 
 
 		 662 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.22 
 
 		 651 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.04859 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  34.65 
 
 		 663 aa  128  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.77 
 
 		 661 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.59 
 
 		 662 aa  125  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.84 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 270 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  31.35 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  31.35 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1307  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.65 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.71 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2377  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  34.3 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.76 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  32.38 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6106  short chain enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.53 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.1 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  29.5 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.61 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>