More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1988 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1988  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 268 aa  547  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  93.28 
 
 		 268 aa  520  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3578  enoyl-CoA hydratase  91.42 
 
 		 268 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0354874  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  80.08 
 
 		 267 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3111  enoyl-CoA hydratase  62.3 
 
 		 264 aa  315  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554974  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1561  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.66 
 
 		 258 aa  308  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0605  enoyl-CoA hydratase  61.83 
 
 		 260 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  58.33 
 
 		 273 aa  301  8.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4402  enoyl-CoA hydratase  58.23 
 
 		 257 aa  293  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  55.25 
 
 		 263 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0274  enoyl-CoA hydratase  58.68 
 
 		 260 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00265078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  51.87 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  51.24 
 
 		 256 aa  231  9e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0923  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.93 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.78 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.3 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2366  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000255309  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2560  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 		 263 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4798  enoyl-CoA hydratase  44.86 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.07 
 
 		 651 aa  135  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.84 
 
 		 659 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  33.62 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  33.62 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  32.42 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.52 
 
 		 663 aa  126  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.94 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.58 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.61 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  31.49 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  35.12 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.53 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.31 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.74 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.65 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.13 
 
 		 255 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 		 258 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.63 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.67 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.75 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.18 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.29 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.25 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 251 aa  116  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2377  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  31.9 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.98 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  33.88 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>