More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0994 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 273 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3111  enoyl-CoA hydratase  68.46 
 
 		 264 aa  343  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554974  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4402  enoyl-CoA hydratase  64.29 
 
 		 257 aa  338  7e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0605  enoyl-CoA hydratase  67.63 
 
 		 260 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1561  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.04 
 
 		 258 aa  318  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0274  enoyl-CoA hydratase  66.81 
 
 		 260 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00265078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  61.2 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  58.63 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1988  enoyl-CoA hydratase  58.33 
 
 		 268 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  58.4 
 
 		 263 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3578  enoyl-CoA hydratase  56.47 
 
 		 268 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0354874  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  53.91 
 
 		 261 aa  258  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0923  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.8 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.58 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.58 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  47.15 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2366  enoyl-CoA hydratase  51.43 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000255309  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4798  enoyl-CoA hydratase  48.82 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109954  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2560  enoyl-CoA hydratase  48.55 
 
 		 268 aa  221  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.87 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 		 261 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 		 260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.71 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.28 
 
 		 659 aa  132  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  34.17 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.16 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.4 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  33.47 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.53 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 		 259 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.89 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.32 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.13 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 		 269 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  32.23 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  32.23 
 
 		 258 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 258 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6106  short chain enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0166  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.95 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  30.12 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.58 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2905  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433912  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 		 263 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.78 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>