More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1561 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1561  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
258 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3111  enoyl-CoA hydratase  61.07 
 
 
264 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554974  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  61.04 
 
 
273 aa  318  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0605  enoyl-CoA hydratase  58.85 
 
 
260 aa  314  8e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4402  enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 
257 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
268 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  58.27 
 
 
267 aa  308  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1988  enoyl-CoA hydratase  58.66 
 
 
268 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3578  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 
268 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0354874  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0274  enoyl-CoA hydratase  60.82 
 
 
260 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00265078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  53.52 
 
 
263 aa  288  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  49.39 
 
 
256 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0923  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.8 
 
 
282 aa  245  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.8 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2366  enoyl-CoA hydratase  48.24 
 
 
289 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000255309  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.15 
 
 
252 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  47.79 
 
 
261 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2560  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
268 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4798  enoyl-CoA hydratase  46.94 
 
 
265 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 
263 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
261 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  32.79 
 
 
259 aa  129  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.33 
 
 
257 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  33.89 
 
 
258 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
258 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 
257 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
269 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  32.49 
 
 
260 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
269 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.77 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
252 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
258 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
258 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
265 aa  118  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.67 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0164  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.29 
 
 
659 aa  118  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.22 
 
 
273 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.2 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 
255 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
263 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  29.6 
 
 
255 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  29.32 
 
 
255 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 
258 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.68 
 
 
260 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.29 
 
 
260 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  31.93 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.1 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  30.65 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.98 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  28.8 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  29.48 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  28.11 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  29.32 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  28.92 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  30.24 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  29.12 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.17 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  28.11 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  29.32 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  29.32 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  30.28 
 
 
258 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  30.28 
 
 
258 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
260 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.79 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 
266 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 
268 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
280 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 
261 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 
270 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  31.65 
 
 
251 aa  112  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  35.9 
 
 
257 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.7 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  27.31 
 
 
258 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0173  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00691554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.08 
 
 
663 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 
280 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  27.31 
 
 
258 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  27.31 
 
 
258 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>