More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0605 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0605  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3111  enoyl-CoA hydratase  82.24 
 
 
264 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554974  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4402  enoyl-CoA hydratase  78.08 
 
 
257 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0274  enoyl-CoA hydratase  82.1 
 
 
260 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00265078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  67.63 
 
 
273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1561  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.85 
 
 
258 aa  314  8e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  62.66 
 
 
268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1988  enoyl-CoA hydratase  61.83 
 
 
268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3578  enoyl-CoA hydratase  61.98 
 
 
268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0354874  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  61.79 
 
 
267 aa  299  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  57.54 
 
 
263 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  52.05 
 
 
261 aa  248  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  49.4 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.92 
 
 
252 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2366  enoyl-CoA hydratase  47.06 
 
 
289 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000255309  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2560  enoyl-CoA hydratase  47.31 
 
 
268 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0923  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.73 
 
 
282 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.5 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4798  enoyl-CoA hydratase  47.79 
 
 
265 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
263 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  41.88 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  39.8 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
262 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.71 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
259 aa  123  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.5 
 
 
659 aa  123  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  29.8 
 
 
261 aa  122  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
262 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 
255 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
261 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.85 
 
 
255 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  35.78 
 
 
267 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
261 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.62 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.13 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.33 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
258 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
262 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
258 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
262 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
258 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.45 
 
 
255 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 
258 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  32.64 
 
 
257 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  36.98 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 
258 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 
268 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 
260 aa  115  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
258 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
273 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.22 
 
 
258 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.1 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.5 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  38.69 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  27.08 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.87 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
264 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
264 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1307  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.42 
 
 
252 aa  112  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 
251 aa  112  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 
269 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  30.61 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.98 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.35 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.17 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>