More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3578 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3578  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0354874  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  91.42 
 
 		 268 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1988  enoyl-CoA hydratase  91.42 
 
 		 268 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  80.83 
 
 		 267 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3111  enoyl-CoA hydratase  60.41 
 
 		 264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554974  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0605  enoyl-CoA hydratase  61.98 
 
 		 260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1561  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.03 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4402  enoyl-CoA hydratase  58.63 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  56.47 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0274  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00265078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  54.69 
 
 		 263 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  51.04 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.78 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  50.63 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0923  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.11 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2366  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000255309  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2560  enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4798  enoyl-CoA hydratase  43.78 
 
 		 265 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  43.9 
 
 		 263 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.14 
 
 		 651 aa  129  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.56 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.52 
 
 		 663 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.81 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  35.78 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.45 
 
 		 659 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.35 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.03 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.62 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  32.11 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.18 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  30.96 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  37.06 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.89 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.68 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  31.67 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.42 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  29.76 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 262 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.42 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  33.03 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.88 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.5 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  31.36 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  31.43 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.93 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.03 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  30.5 
 
 		 258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  30.47 
 
 		 263 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.83 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.23 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>