More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2560 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2560  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 268 aa  547  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2366  enoyl-CoA hydratase  50.78 
 
 		 289 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000255309  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0605  enoyl-CoA hydratase  47.31 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3111  enoyl-CoA hydratase  46.01 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554974  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4402  enoyl-CoA hydratase  47.56 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1561  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.12 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  48.55 
 
 		 273 aa  221  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0274  enoyl-CoA hydratase  45.21 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00265078  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3578  enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0354874  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  45.93 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1988  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138891  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0923  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.96 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  44.58 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4798  enoyl-CoA hydratase  40.84 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 263 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  36.91 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  34.31 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  34.31 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  32.1 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.79 
 
 		 659 aa  113  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  31.28 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.83 
 
 		 651 aa  109  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.8 
 
 		 662 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  32.88 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.84 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  32.71 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.81 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 258 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  30.23 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  37.82 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.8 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.79 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.36 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.03 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  30.73 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2036  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  37.57 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 		 259 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.27 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  33.99 
 
 		 663 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2897  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  35.24 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  32.87 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  39.05 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.48 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>