More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2366 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2366  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 289 aa  597  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000255309  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2560  enoyl-CoA hydratase  50.78 
 
 		 268 aa  255  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  48.84 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0923  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1561  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.24 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4402  enoyl-CoA hydratase  47.69 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  51.43 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0605  enoyl-CoA hydratase  47.06 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.64 
 
 		 250 aa  225  6e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0274  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00265078  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 		 263 aa  221  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3111  enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554974  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3578  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 		 268 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0354874  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  44.62 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1988  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 		 268 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  44.08 
 
 		 268 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 		 261 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4798  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  33.46 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  33.46 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 		 259 aa  122  8e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 		 256 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.53 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  31.17 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.11 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  29.13 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.11 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.28 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.61 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  34.05 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.77 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.03 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.79 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.18 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  29.21 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  28 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  27.95 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.33 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  28.14 
 
 		 657 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.71 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  29.23 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.39 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  29.66 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.79 
 
 		 659 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  28.84 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6106  short chain enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 		 256 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.51 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.13 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 		 255 aa  99  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30.77 
 
 		 255 aa  99  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2377  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  29.34 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  29.18 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.41 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  30.3 
 
 		 263 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  26.95 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30.77 
 
 		 255 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.31 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  27.51 
 
 		 662 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.2 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  27.38 
 
 		 258 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  27.38 
 
 		 258 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  28.76 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  27.38 
 
 		 258 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 		 264 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>