More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4402 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4402  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 257 aa  524  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0605  enoyl-CoA hydratase  78.08 
 
 		 260 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3111  enoyl-CoA hydratase  77.91 
 
 		 264 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554974  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0274  enoyl-CoA hydratase  75.41 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00265078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  64.29 
 
 		 273 aa  338  5.9999999999999996e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1561  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.91 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3578  enoyl-CoA hydratase  58.63 
 
 		 268 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0354874  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  59.75 
 
 		 268 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1988  enoyl-CoA hydratase  58.23 
 
 		 268 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  57.83 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  56.22 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  52 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2366  enoyl-CoA hydratase  47.69 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000255309  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.34 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4798  enoyl-CoA hydratase  47.66 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109954  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2560  enoyl-CoA hydratase  47.56 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.16 
 
 		 250 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0923  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191256 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.72 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  27.69 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.88 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.04 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.46 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.59 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30.58 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  29.41 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  28.46 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.37 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  32.79 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  28.46 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  33.17 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1307  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.97 
 
 		 659 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  30.89 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.71 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  33.8 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  30.47 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  27.67 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.64 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.93 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  37.37 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  27.17 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.17 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.65 
 
 		 263 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.36 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.69 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.62 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>