More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2636 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
204 aa  400  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2998  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.95 
 
 
206 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.172994  normal  0.145485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0406  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.66 
 
 
203 aa  235  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00846941  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0913  enoyl-CoA hydratase  64.67 
 
 
206 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.07 
 
 
206 aa  208  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.87 
 
 
206 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.419854  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0067  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.54 
 
 
248 aa  194  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315563 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.78 
 
 
256 aa  111  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  32.23 
 
 
258 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  32.23 
 
 
258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  38.86 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.32 
 
 
659 aa  105  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
257 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33 
 
 
661 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
662 aa  102  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.51 
 
 
662 aa  102  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 
261 aa  101  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
252 aa  101  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
260 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.31 
 
 
663 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
261 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 
266 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.67 
 
 
260 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.66 
 
 
254 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.74 
 
 
260 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
254 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 
257 aa  99.4  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
258 aa  99  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.02 
 
 
662 aa  98.6  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
260 aa  98.2  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.17 
 
 
258 aa  98.2  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
265 aa  97.8  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
258 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 
257 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
257 aa  96.7  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
267 aa  95.9  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
253 aa  96.3  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
257 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
261 aa  96.3  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.42 
 
 
260 aa  96.3  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1546  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 
254 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 
267 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
262 aa  95.5  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 
260 aa  95.1  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 
256 aa  95.1  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4679  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.04 
 
 
258 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.02 
 
 
278 aa  95.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.39 
 
 
260 aa  95.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
263 aa  95.1  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
262 aa  95.1  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10923  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
243 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269045  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0897  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
265 aa  94.7  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.51 
 
 
260 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.46 
 
 
258 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.9 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.7 
 
 
258 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04074  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04036  hypothetical protein  37.04 
 
 
260 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.13651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1912  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
260 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
259 aa  93.2  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.78 
 
 
275 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
260 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  35.64 
 
 
267 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.82 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4452  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.51 
 
 
258 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202133  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4769  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.04 
 
 
258 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
259 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  34.05 
 
 
273 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
260 aa  92.4  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
258 aa  92.4  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3275  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 
269 aa  92.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.45 
 
 
260 aa  92  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4812  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
244 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365377  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
269 aa  92  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4431  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
244 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4518  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
244 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 
281 aa  91.7  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2484  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.81 
 
 
257 aa  91.3  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.585223  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 
259 aa  91.3  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  34.03 
 
 
261 aa  91.3  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.5 
 
 
265 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4743  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.98 
 
 
258 aa  90.9  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0219065  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.9 
 
 
651 aa  90.9  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
254 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.05 
 
 
260 aa  90.9  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 
254 aa  90.5  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3658  short chain enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  33.5 
 
 
263 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3731  short chain enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
263 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
263 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
263 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
263 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 
280 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
263 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
263 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>