More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4708 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.04 
 
 
267 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  45.74 
 
 
260 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46 
 
 
266 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 
266 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.3 
 
 
273 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  44.79 
 
 
268 aa  203  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
267 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
265 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
260 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  43.6 
 
 
266 aa  195  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 
266 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.21 
 
 
272 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  44.22 
 
 
262 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.05 
 
 
267 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
287 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 
262 aa  185  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
266 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
267 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 
264 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  41.46 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0087  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 
263 aa  178  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0306  enoyl-CoA hydratase  43.56 
 
 
261 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630829  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0316  enoyl-CoA hydratase  43.56 
 
 
261 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0297  enoyl-CoA hydratase  43.56 
 
 
261 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.68 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  39.55 
 
 
278 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.24 
 
 
273 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
264 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
259 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
264 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
257 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
264 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
268 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
257 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  39.66 
 
 
257 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
259 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
259 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
273 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
264 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
259 aa  141  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
260 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
267 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
257 aa  139  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
265 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.18 
 
 
260 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
257 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 
280 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
257 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 
287 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
258 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
263 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
260 aa  135  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
263 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.59 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  37.19 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
265 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
255 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
256 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
264 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 
259 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.94 
 
 
260 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>