More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2378 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.59 
 
 
275 aa  274  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 
294 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  50.39 
 
 
282 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 
276 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
281 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
281 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  51.33 
 
 
275 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  51.15 
 
 
270 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 
270 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.92 
 
 
275 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
270 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.32 
 
 
268 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.04 
 
 
262 aa  221  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.05 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.82 
 
 
313 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
270 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
272 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.03 
 
 
261 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0222  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.12 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 
297 aa  171  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
271 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.53 
 
 
279 aa  168  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2004  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.14 
 
 
274 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 
294 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
271 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
285 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
285 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
285 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  37.92 
 
 
298 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 
296 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.13 
 
 
263 aa  155  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
262 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0712  enoyl-CoA hydratase  43.33 
 
 
226 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
263 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
263 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
263 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  39.33 
 
 
293 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
261 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.63 
 
 
257 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.2 
 
 
262 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
262 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  34.67 
 
 
309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  35.58 
 
 
262 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.55 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
260 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
262 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 
254 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
254 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
265 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 
273 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
260 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 
289 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
256 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  34.71 
 
 
307 aa  141  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  38.68 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
282 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 
296 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
262 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  30.8 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
267 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.05 
 
 
258 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
264 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
264 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  35.58 
 
 
291 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
258 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 
266 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
259 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4185  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
262 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.9 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  36.1 
 
 
258 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
260 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>