More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0367 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
254 aa  513  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  99.61 
 
 
254 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  89.76 
 
 
254 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  66.67 
 
 
258 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  67.05 
 
 
258 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  64.4 
 
 
254 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  63.78 
 
 
256 aa  329  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0664  enoyl-CoA hydratase  65.35 
 
 
256 aa  314  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556097  normal  0.974332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  63.89 
 
 
256 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0567  enoyl-CoA hydratase  65.75 
 
 
259 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0200  enoyl-CoA hydratase  65.75 
 
 
254 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.627685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0698  enoyl-CoA hydratase  65.75 
 
 
280 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2333  enoyl-CoA hydratase  65.75 
 
 
254 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0683  enoyl-CoA hydratase  65.75 
 
 
280 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0860  enoyl-CoA hydratase  65.75 
 
 
280 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2413  enoyl-CoA hydratase  65.75 
 
 
280 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2745  enoyl-CoA hydratase  65.75 
 
 
280 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  63.49 
 
 
255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  63.49 
 
 
255 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  63.49 
 
 
255 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  56.63 
 
 
258 aa  295  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  56.63 
 
 
258 aa  295  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  63.1 
 
 
255 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  59.04 
 
 
257 aa  291  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  58.8 
 
 
274 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2770  enoyl-CoA hydratase  64.29 
 
 
255 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2636  enoyl-CoA hydratase  63.89 
 
 
255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  55.08 
 
 
264 aa  287  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3473  enoyl-CoA hydratase  58.57 
 
 
261 aa  285  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0427069  normal  0.591102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0820  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 
254 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  56.68 
 
 
254 aa  274  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 
258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0414  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 
256 aa  271  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0435111  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.19 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4029  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 
254 aa  252  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.61 
 
 
262 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
245 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.44 
 
 
245 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  44.03 
 
 
245 aa  215  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  44.03 
 
 
245 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.84 
 
 
257 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.39 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.43 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.39 
 
 
245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.39 
 
 
245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.39 
 
 
245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.39 
 
 
245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
245 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.85 
 
 
258 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  46.88 
 
 
258 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
246 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.39 
 
 
246 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4899  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.83 
 
 
257 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3229  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.21 
 
 
245 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.23 
 
 
250 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.75 
 
 
245 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 
254 aa  198  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.31 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.212368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.9 
 
 
248 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
256 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2378  enoyl-CoA hydratase  43.65 
 
 
257 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.0124738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2174  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
248 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.262533  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.63 
 
 
279 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.21 
 
 
264 aa  191  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.63 
 
 
253 aa  191  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.06 
 
 
259 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.06 
 
 
259 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1027  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.74 
 
 
264 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.74 
 
 
253 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4449  enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.75 
 
 
245 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2861  enoyl-CoA hydratase  45.71 
 
 
257 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.1 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2485  enoyl-CoA hydratase  40.83 
 
 
253 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4754  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.02 
 
 
242 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0527  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
249 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.850744  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 
255 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1748  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.44 
 
 
260 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.828974  normal  0.0355231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.17 
 
 
260 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0601  enoyl-CoA hydratase  42.67 
 
 
251 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456666  normal  0.324394 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0673  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.83 
 
 
241 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1056  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.59 
 
 
245 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2371  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.04 
 
 
254 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0419  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0411  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
250 aa  162  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.477081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0488  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 
250 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308254  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2840  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 
252 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.339924  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0987  enoyl-CoA hydratase  39.83 
 
 
252 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 
260 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0556  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1086  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
259 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 
257 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
252 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.490827  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1846  enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 
263 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.07 
 
 
263 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>