More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0712 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0712  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
226 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0222  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.75 
 
 
274 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  42.22 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  41.78 
 
 
281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  41.78 
 
 
281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 
294 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 
270 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 
282 aa  158  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  39.64 
 
 
270 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  41.01 
 
 
275 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.52 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  43.33 
 
 
257 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.23 
 
 
281 aa  151  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  40.28 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.71 
 
 
262 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
275 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
268 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
313 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.18 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 
272 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
270 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 
269 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  36.32 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  35.68 
 
 
270 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.73 
 
 
279 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2004  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.32 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  36.41 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
254 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  33.5 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 
264 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.71 
 
 
263 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
290 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33 
 
 
271 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
285 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
276 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
261 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.84 
 
 
271 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 
256 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.5 
 
 
274 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
262 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  32.87 
 
 
291 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
297 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  32.72 
 
 
270 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
260 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.51 
 
 
271 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  33.63 
 
 
290 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 
264 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.92 
 
 
271 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
267 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
273 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.99 
 
 
259 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
274 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
265 aa  101  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  32.04 
 
 
260 aa  101  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 
261 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  35.47 
 
 
262 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
257 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.64 
 
 
262 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3990  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.27 
 
 
267 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592711  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 
263 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 
263 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 
263 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 
263 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 
263 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 
263 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 
263 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  33.8 
 
 
254 aa  99.4  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.5 
 
 
270 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.25 
 
 
967 aa  99.4  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  30.88 
 
 
263 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  99  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.73 
 
 
260 aa  99  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
301 aa  98.6  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  30.21 
 
 
296 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  36.79 
 
 
255 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  36.79 
 
 
255 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  36.79 
 
 
255 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  36.27 
 
 
256 aa  98.6  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.49 
 
 
262 aa  97.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  31.22 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.97 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
270 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
289 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>