More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0389 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  77.91 
 
 		 258 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  67.05 
 
 		 254 aa  347  7e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  66.67 
 
 		 254 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  67.05 
 
 		 254 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  61.63 
 
 		 254 aa  317  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  64.98 
 
 		 256 aa  307  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0664  enoyl-CoA hydratase  65.76 
 
 		 256 aa  292  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556097  normal  0.974332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 		 264 aa  284  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  57.71 
 
 		 257 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 258 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 		 256 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  57.09 
 
 		 274 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 		 255 aa  275  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  62.5 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  62.5 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0683  enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 		 280 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3473  enoyl-CoA hydratase  55.69 
 
 		 261 aa  268  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0427069  normal  0.591102 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2333  enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0200  enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.627685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2745  enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0860  enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2413  enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0698  enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 		 280 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0820  enoyl-CoA hydratase  57.09 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0567  enoyl-CoA hydratase  61.87 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  62.1 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2770  enoyl-CoA hydratase  63.31 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2636  enoyl-CoA hydratase  62.9 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.98 
 
 		 261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  57.32 
 
 		 258 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  55.87 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0414  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0435111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4029  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.61 
 
 		 254 aa  241  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.22 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 245 aa  215  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.21 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 245 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.16 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.43 
 
 		 259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.43 
 
 		 259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4899  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.95 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  43.97 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.97 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.16 
 
 		 246 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46 
 
 		 256 aa  201  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.18 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4449  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.58 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2378  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.0124738 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3229  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.39 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.34 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.34 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.74 
 
 		 279 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0601  enoyl-CoA hydratase  48.33 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456666  normal  0.324394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.212368  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.15 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4754  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.24 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1027  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.4 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0527  enoyl-CoA hydratase  43.28 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.850744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2174  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.262533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.19 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2485  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.33 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2371  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0673  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.36 
 
 		 241 aa  168  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2861  enoyl-CoA hydratase  43.5 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0987  enoyl-CoA hydratase  46.83 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0419  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1748  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.828974  normal  0.0355231 
 
 
-
 
NC_004310  BR0411  enoyl-CoA hydratase  37.76 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.477081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0488  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1086  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1056  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.74 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2840  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.27 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.339924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0556  enoyl-CoA hydratase  43.52 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0835  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 		 220 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0159384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0340  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.486328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0776808  normal  0.568197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2760  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4289  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.2 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186398  normal  0.756398 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  35.19 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1846  enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>