More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0222 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0222  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 274 aa  562  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0712  enoyl-CoA hydratase  51.75 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  42.16 
 
 		 270 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  42.12 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  43.56 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  43.12 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.14 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.41 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.29 
 
 		 313 aa  188  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 276 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  39.05 
 
 		 270 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.25 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  38.18 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.18 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2004  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.17 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  32.38 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 		 279 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  35.54 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  32.74 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 		 291 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  32.62 
 
 		 296 aa  131  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.99 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  32.09 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  34.91 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  31.32 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.02 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  32.62 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.39 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  33.05 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.48 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.43 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  29.68 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  30.22 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  33.1 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  33.45 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.36 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  31.39 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.36 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  30.66 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  32.85 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  31.02 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  32.83 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  30.63 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0501  enoyl-CoA hydratase  34.89 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.2 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.84 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  29.45 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  28.52 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  29.6 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  31.36 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.57 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.83 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.37 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.82 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  29.78 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  30.51 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>