More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1856 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
288 aa  573  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  64.81 
 
 
288 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60 
 
 
293 aa  335  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  56.63 
 
 
292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  48.96 
 
 
294 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  47.81 
 
 
301 aa  252  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  50.9 
 
 
290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  51.57 
 
 
291 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  47.95 
 
 
296 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  46.88 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  46.53 
 
 
296 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.43 
 
 
297 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  49.15 
 
 
295 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
309 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
296 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  49.65 
 
 
293 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  48.25 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  42.16 
 
 
298 aa  198  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.18 
 
 
290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.73 
 
 
282 aa  188  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
291 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  39.26 
 
 
291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
271 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  36.93 
 
 
285 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  36.93 
 
 
285 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
285 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 
271 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
271 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.46 
 
 
274 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 
267 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.71 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.91 
 
 
264 aa  145  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
265 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 
273 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  33.69 
 
 
263 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.46 
 
 
273 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.1 
 
 
259 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
264 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.93 
 
 
263 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
265 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.81 
 
 
269 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3692  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.01 
 
 
179 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
266 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.76 
 
 
278 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.23 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.35 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  33.69 
 
 
264 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  31.9 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.1 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  37.09 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.81 
 
 
270 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  32.74 
 
 
263 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
264 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.57 
 
 
272 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  32.1 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.48 
 
 
256 aa  127  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
270 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.81 
 
 
264 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
260 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
273 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 
262 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  34.46 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.41 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  30.63 
 
 
294 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 
263 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
276 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 
270 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.46 
 
 
268 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
268 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
266 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
264 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  32.75 
 
 
263 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
258 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
267 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 
287 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.88 
 
 
262 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 
267 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>