More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3284 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
272 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  70.41 
 
 
287 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  70.41 
 
 
287 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  68.77 
 
 
278 aa  384  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0087  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.98 
 
 
263 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.85 
 
 
268 aa  327  9e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  50.99 
 
 
268 aa  268  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.87 
 
 
266 aa  265  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  50.21 
 
 
267 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  48.43 
 
 
266 aa  261  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.82 
 
 
266 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  48.46 
 
 
264 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 
265 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  48.62 
 
 
265 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.43 
 
 
266 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.78 
 
 
267 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  47.41 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  45.21 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  46.61 
 
 
262 aa  237  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  48.36 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  48.36 
 
 
260 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  44.15 
 
 
269 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  47.95 
 
 
260 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  47.95 
 
 
260 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 
273 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.04 
 
 
267 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0297  enoyl-CoA hydratase  45.06 
 
 
261 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0306  enoyl-CoA hydratase  45.06 
 
 
261 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630829  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0316  enoyl-CoA hydratase  45.06 
 
 
261 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.21 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
267 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.25 
 
 
264 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 
273 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
260 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 
271 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
271 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
271 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
273 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
268 aa  145  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
267 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
257 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
267 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
269 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
267 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
258 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2897  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.43 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
260 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
259 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
265 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
274 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
264 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  136  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
257 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.33 
 
 
260 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
263 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
260 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.74 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.74 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
258 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.14 
 
 
257 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.09 
 
 
262 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
263 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
270 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
260 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.82 
 
 
659 aa  131  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.29 
 
 
661 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.09 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.07 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.82 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.98 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.46 
 
 
256 aa  130  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.83 
 
 
278 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.04 
 
 
651 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>