More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2057 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.54 
 
 
287 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.16 
 
 
287 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.77 
 
 
272 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0087  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.08 
 
 
263 aa  332  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.25 
 
 
268 aa  313  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  51.54 
 
 
266 aa  278  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  52.9 
 
 
268 aa  276  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.34 
 
 
266 aa  275  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  52.31 
 
 
267 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.81 
 
 
266 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 
266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  51.74 
 
 
265 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  51.92 
 
 
264 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  50.38 
 
 
262 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  50.58 
 
 
265 aa  258  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  53.66 
 
 
261 aa  254  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
267 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  47.64 
 
 
266 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
264 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  49.02 
 
 
262 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 
269 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  49.02 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  48.24 
 
 
260 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  44.02 
 
 
266 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  48.63 
 
 
260 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  48.63 
 
 
260 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.92 
 
 
267 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.61 
 
 
273 aa  218  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0316  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
261 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0297  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
261 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0306  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
261 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.47 
 
 
267 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  39.55 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
264 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
264 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 
257 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
259 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
271 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
271 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
267 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 
260 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
261 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 
264 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 
269 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.26 
 
 
273 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
273 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
264 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
265 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
269 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
261 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 
258 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
267 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
265 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
259 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
268 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
260 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
259 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
259 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
259 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.010448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
255 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.84 
 
 
264 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.82 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  34.46 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.26 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 
260 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.4 
 
 
662 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.84 
 
 
661 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  34.9 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 
296 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 
260 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
259 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.24 
 
 
258 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
257 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 
263 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 
267 aa  138  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>