More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5262 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  86.49 
 
 
296 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  88.51 
 
 
296 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  86.49 
 
 
309 aa  507  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  69.31 
 
 
301 aa  408  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  63.05 
 
 
294 aa  368  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  63.18 
 
 
295 aa  361  8e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  62.37 
 
 
289 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  59.32 
 
 
290 aa  354  8.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.38 
 
 
297 aa  347  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  61.49 
 
 
293 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  63.82 
 
 
291 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  53.09 
 
 
307 aa  322  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.32 
 
 
282 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  58.98 
 
 
299 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  54.21 
 
 
298 aa  304  9.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  51.01 
 
 
292 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  49.83 
 
 
291 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  51.06 
 
 
288 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.47 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  47.95 
 
 
288 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.11 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  44.69 
 
 
285 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  44.69 
 
 
285 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  44.32 
 
 
285 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  37.94 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.63 
 
 
274 aa  192  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  41.99 
 
 
270 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  37.76 
 
 
275 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
270 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  38.38 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
271 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
275 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 
271 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
271 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 
270 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
276 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
294 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 
274 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
281 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
281 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.73 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
264 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
269 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.89 
 
 
268 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
282 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
269 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
257 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.89 
 
 
279 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.17 
 
 
257 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  38.27 
 
 
265 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
257 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
260 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.54 
 
 
263 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
259 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  37.83 
 
 
272 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.84 
 
 
257 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 
262 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
257 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.63 
 
 
270 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.41 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.89 
 
 
275 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  37.06 
 
 
264 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
257 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
257 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
263 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
264 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.75 
 
 
263 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
265 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
260 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.84 
 
 
263 aa  148  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
262 aa  146  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  37.09 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  37.19 
 
 
262 aa  145  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
260 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  34.89 
 
 
258 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.13 
 
 
257 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 
261 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.63 
 
 
260 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.46 
 
 
258 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
260 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
273 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
263 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.37 
 
 
262 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
263 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.53 
 
 
260 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.64 
 
 
262 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
268 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
262 aa  142  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
263 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.09 
 
 
262 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>