More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4068 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 267 aa  518  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.26 
 
 		 262 aa  336  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  56.08 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.36 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0893  enoyl-CoA hydratase  57.52 
 
 		 271 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  48.64 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  52.94 
 
 		 262 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.41 
 
 		 270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  43.4 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0278  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  48.85 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40.91 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  34.75 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.63 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.82 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0814  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 		 263 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0407  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 284 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  33.89 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.83 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 		 270 aa  138  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 		 265 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.46 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3229  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 		 245 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 245 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 245 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 245 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 245 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 245 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 245 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  41.86 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>