More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1401 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
270 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  51.71 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.64 
 
 
276 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  53.28 
 
 
262 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  49.21 
 
 
266 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.41 
 
 
267 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.8 
 
 
262 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0893  enoyl-CoA hydratase  54 
 
 
271 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0782068  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0278  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0407  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
261 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.47 
 
 
257 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 
262 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.82 
 
 
262 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.74 
 
 
270 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 
263 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
263 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
263 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
263 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
263 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
263 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
263 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
263 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 
267 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
266 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  34.85 
 
 
261 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
263 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 
259 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
264 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
270 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
263 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 
260 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2835  putative enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
261 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
260 aa  166  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
259 aa  165  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
264 aa  165  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11165  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.192459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 
263 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.88 
 
 
263 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 
260 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.93 
 
 
264 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
261 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 
266 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
265 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
258 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 
263 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
264 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
259 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
259 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
259 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
284 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
263 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.81 
 
 
264 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
264 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
266 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
280 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
265 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 
273 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
263 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
261 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.41 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 
266 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
256 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
263 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
256 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
259 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
263 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
264 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
264 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
261 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
263 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 
262 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
260 aa  148  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.29 
 
 
659 aa  148  8e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4145  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4299  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621755  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4070  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 
261 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  36.07 
 
 
259 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>