More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0278 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0278  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
262 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  48.4 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.2 
 
 
262 aa  211  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.3 
 
 
270 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 
267 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
276 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  42.4 
 
 
260 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  43.31 
 
 
266 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
262 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0893  enoyl-CoA hydratase  50.6 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0782068  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.65 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 
264 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
266 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 
263 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.59 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
263 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
263 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 
262 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
270 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
263 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
264 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
284 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 
260 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  30.62 
 
 
261 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 
263 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 
263 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
264 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
263 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 
263 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
260 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 
263 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
262 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
270 aa  148  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2835  putative enoyl-CoA hydratase  40.33 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 
262 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
267 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 
273 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
263 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 
262 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.65 
 
 
262 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 
262 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
263 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
280 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
262 aa  143  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
263 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
263 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
263 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
256 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
263 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
263 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
263 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
263 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
263 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
259 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
266 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 
264 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0407  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.81 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.56 
 
 
263 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 
255 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 
259 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0721  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.834071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
261 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
263 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
263 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
276 aa  138  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
264 aa  138  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
264 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1071  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
262 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4396  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
262 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000474445  hitchhiker  2.81205e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0935  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
262 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.220694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0979  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
262 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0848  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
262 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0791  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
262 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0796  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
262 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  29.06 
 
 
265 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0979  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
262 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.02824e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0894  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
262 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.975576  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.68 
 
 
271 aa  135  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  34.72 
 
 
262 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
256 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>