More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3203 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3203  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
286 aa  553  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 
262 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0895  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.87 
 
 
260 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 
264 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  43.54 
 
 
259 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  43.54 
 
 
259 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  43.54 
 
 
259 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
261 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0814  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
262 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134124  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1259  enoyl-CoA hydratase  41.78 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.38 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  36.28 
 
 
266 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  36.28 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.4 
 
 
263 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
264 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  38.14 
 
 
268 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  28.68 
 
 
261 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.38 
 
 
261 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
264 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 
263 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  38.6 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
263 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 
263 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  36.07 
 
 
267 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 
263 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35.62 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.68 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
265 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.05 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.28 
 
 
263 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
262 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 
273 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 
262 aa  113  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
262 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35 
 
 
263 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 
264 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
263 aa  112  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
274 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.33 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.18 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  37.95 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  39.81 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
260 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.07 
 
 
267 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  35.75 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.7 
 
 
270 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 
263 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  33.8 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.46 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 
271 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 
260 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
263 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
272 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 
267 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 
263 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 
267 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
273 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 
259 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
272 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
272 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 
271 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  35.62 
 
 
262 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
270 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
261 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
265 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
278 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
263 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  30 
 
 
262 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
259 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  35.31 
 
 
283 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
264 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 
258 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0786  enoyl-CoA hydratase  29.3 
 
 
262 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
257 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
263 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
263 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
263 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
263 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
280 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>