More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0973 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  82.63 
 
 		 259 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  69.5 
 
 		 259 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  69.5 
 
 		 259 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  70.66 
 
 		 259 aa  348  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1984  enoyl-CoA hydratase  62.21 
 
 		 262 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1370  enoyl-CoA hydratase  61.07 
 
 		 262 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57851  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3185  enoyl-CoA hydratase  60.69 
 
 		 262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 		 355 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  64.12 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  64.12 
 
 		 263 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  64.12 
 
 		 263 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1050  enoyl-CoA hydratase  63.74 
 
 		 263 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00724493  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2144  enoyl-CoA hydratase  63.74 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309295  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2265  enoyl-CoA hydratase  63.74 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  59.07 
 
 		 259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1316  enoyl-CoA hydratase  63.36 
 
 		 263 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5555  enoyl-CoA hydratase  65.65 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1156  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0739971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1803  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1463  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0439  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0712  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.518843  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1325  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1914  enoyl-CoA hydratase  56.37 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.483428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  54.44 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2631  enoyl-CoA hydratase  55.04 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0399422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 255 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1949  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1397  enoyl-CoA hydratase  45.67 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4311  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  43.44 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2591  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156463  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3016  enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3735  enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.08 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 264 aa  148  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.82 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.1 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.1 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.1 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.33 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.23 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  33.06 
 
 		 283 aa  138  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 264 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 257 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.52 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 260 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 		 258 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>