More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3016 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3016  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
274 aa  547  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3735  enoyl-CoA hydratase  98.54 
 
 
276 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1397  enoyl-CoA hydratase  86.59 
 
 
266 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4311  enoyl-CoA hydratase  81.85 
 
 
269 aa  355  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  67.32 
 
 
273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2591  enoyl-CoA hydratase  64.34 
 
 
268 aa  295  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156463  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 
272 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
259 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
259 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 
259 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  43.7 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  52.36 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 
259 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1914  enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.483428  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  46.46 
 
 
259 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2144  enoyl-CoA hydratase  48.19 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309295  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2265  enoyl-CoA hydratase  48.19 
 
 
263 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2631  enoyl-CoA hydratase  46.85 
 
 
259 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0399422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3185  enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 
262 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1050  enoyl-CoA hydratase  46.27 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00724493  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1984  enoyl-CoA hydratase  45.06 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1370  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 
262 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57851  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 
263 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 
263 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 
263 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  45.78 
 
 
355 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1156  enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 
263 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0739971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0712  enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 
263 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.518843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1803  enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 
263 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1325  enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 
263 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1463  enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 
263 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0439  enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 
263 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1316  enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 
263 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5555  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
263 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
266 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 
263 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1949  enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 
257 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
266 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
257 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
263 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
262 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 
263 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
284 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
263 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
261 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
262 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
266 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
267 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
260 aa  142  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
261 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0895  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
261 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 
255 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 
262 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
266 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
266 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  30.59 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 
260 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 
264 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
264 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
262 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 
259 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  39.01 
 
 
263 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  39.01 
 
 
263 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  39.01 
 
 
263 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  39.01 
 
 
263 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 
265 aa  135  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  39.01 
 
 
263 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  39.01 
 
 
263 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  39.01 
 
 
263 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38.12 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
260 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
267 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
267 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  30.47 
 
 
265 aa  132  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
259 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
268 aa  132  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>