More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2631 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2631  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 259 aa  520  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0399422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  70.93 
 
 		 259 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1914  enoyl-CoA hydratase  68.6 
 
 		 259 aa  314  9e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.483428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  67.44 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  55.04 
 
 		 259 aa  275  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.87 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.48 
 
 		 255 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  51.94 
 
 		 259 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  51.94 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 		 259 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  53.49 
 
 		 259 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1370  enoyl-CoA hydratase  54.96 
 
 		 262 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57851  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3185  enoyl-CoA hydratase  54.2 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 		 355 aa  245  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1050  enoyl-CoA hydratase  58.02 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00724493  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1984  enoyl-CoA hydratase  54.02 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  54.96 
 
 		 263 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  54.96 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  54.96 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2144  enoyl-CoA hydratase  56.11 
 
 		 263 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309295  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2265  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1316  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1803  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1463  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1156  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0739971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0712  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.518843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0439  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1325  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5555  enoyl-CoA hydratase  54.96 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1949  enoyl-CoA hydratase  49.79 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2591  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1397  enoyl-CoA hydratase  46.85 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3735  enoyl-CoA hydratase  47.24 
 
 		 276 aa  164  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3016  enoyl-CoA hydratase  46.85 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4311  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.29 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.59 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.73 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.95 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.68 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09128  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01210)  32.79 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  28.46 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.08 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.13 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.31 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  31.01 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.2 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.13 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.02 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  32.79 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  29.64 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.92 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.29 
 
 		 253 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  28.17 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>