More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0840 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 273 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2591  enoyl-CoA hydratase  73.15 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1397  enoyl-CoA hydratase  67.92 
 
 		 266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3016  enoyl-CoA hydratase  67.32 
 
 		 274 aa  295  8e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4311  enoyl-CoA hydratase  67.55 
 
 		 269 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3735  enoyl-CoA hydratase  66.93 
 
 		 276 aa  292  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  50.78 
 
 		 272 aa  211  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  45.28 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 		 259 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  44.09 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  43.44 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2144  enoyl-CoA hydratase  48.98 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309295  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2265  enoyl-CoA hydratase  48.98 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1050  enoyl-CoA hydratase  48.77 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00724493  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.28 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  48.75 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  47.35 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  47.35 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  47.35 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.28 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1984  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1370  enoyl-CoA hydratase  43.97 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57851  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1325  enoyl-CoA hydratase  48.33 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1803  enoyl-CoA hydratase  48.33 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1463  enoyl-CoA hydratase  48.33 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1156  enoyl-CoA hydratase  48.33 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0739971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  47.81 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0439  enoyl-CoA hydratase  48.33 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0712  enoyl-CoA hydratase  48.33 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.518843  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3185  enoyl-CoA hydratase  45 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1316  enoyl-CoA hydratase  47.92 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1914  enoyl-CoA hydratase  46.43 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.483428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5555  enoyl-CoA hydratase  47.5 
 
 		 263 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  43.31 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2631  enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0399422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1949  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 		 261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0895  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 		 264 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.95 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  29.57 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.23 
 
 		 262 aa  129  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  30.23 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 		 259 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.18 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.34 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  34.46 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>