More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1914 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1914  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
259 aa  522  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.483428  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  81.08 
 
 
259 aa  411  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2631  enoyl-CoA hydratase  68.6 
 
 
259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0399422  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  65.25 
 
 
259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  56.37 
 
 
259 aa  297  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  55.98 
 
 
259 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.82 
 
 
255 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.82 
 
 
255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  58.69 
 
 
259 aa  284  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  62.26 
 
 
355 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  55.98 
 
 
259 aa  278  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  61.48 
 
 
263 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  61.09 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  61.09 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  56.37 
 
 
259 aa  270  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3185  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
262 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1984  enoyl-CoA hydratase  58.75 
 
 
262 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1370  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
262 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57851  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1803  enoyl-CoA hydratase  62.26 
 
 
263 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0712  enoyl-CoA hydratase  62.26 
 
 
263 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.518843  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1156  enoyl-CoA hydratase  62.26 
 
 
263 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0739971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1463  enoyl-CoA hydratase  62.26 
 
 
263 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0439  enoyl-CoA hydratase  62.26 
 
 
263 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1325  enoyl-CoA hydratase  62.26 
 
 
263 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2144  enoyl-CoA hydratase  61.09 
 
 
263 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309295  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1050  enoyl-CoA hydratase  60.96 
 
 
263 aa  258  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00724493  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1316  enoyl-CoA hydratase  61.87 
 
 
263 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2265  enoyl-CoA hydratase  60.7 
 
 
263 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5555  enoyl-CoA hydratase  61.09 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1949  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
272 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1397  enoyl-CoA hydratase  48.44 
 
 
266 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3016  enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3735  enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 
276 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  46.94 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2591  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
268 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.1 
 
 
262 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4311  enoyl-CoA hydratase  48.25 
 
 
269 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
263 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
262 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.97 
 
 
261 aa  146  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
263 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
266 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
261 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
260 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  32.79 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
263 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
264 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
263 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 
258 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
262 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
262 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
264 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
264 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
264 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
276 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
251 aa  132  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
261 aa  131  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0895  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
254 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 
262 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
263 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
260 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
256 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
284 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
270 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
259 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.15 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>