More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2227 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  99.62 
 
 
263 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2144  enoyl-CoA hydratase  94.3 
 
 
263 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309295  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2265  enoyl-CoA hydratase  94.3 
 
 
263 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1050  enoyl-CoA hydratase  90.87 
 
 
263 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00724493  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5555  enoyl-CoA hydratase  94.68 
 
 
263 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  82.51 
 
 
355 aa  410  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0439  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 
263 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1803  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 
263 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1463  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 
263 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1316  enoyl-CoA hydratase  83.27 
 
 
263 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1156  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 
263 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0739971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0712  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 
263 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.518843  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1325  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 
263 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1370  enoyl-CoA hydratase  75.57 
 
 
262 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57851  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1984  enoyl-CoA hydratase  76.72 
 
 
262 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3185  enoyl-CoA hydratase  74.81 
 
 
262 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  64.12 
 
 
259 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  62.98 
 
 
259 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  59.16 
 
 
259 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  61.45 
 
 
259 aa  295  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  59.54 
 
 
259 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 
259 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1914  enoyl-CoA hydratase  61.09 
 
 
259 aa  265  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.483428  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  58.47 
 
 
259 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2631  enoyl-CoA hydratase  54.96 
 
 
259 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0399422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.87 
 
 
255 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.87 
 
 
255 aa  226  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  54.47 
 
 
272 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1949  enoyl-CoA hydratase  49.05 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  47.35 
 
 
273 aa  178  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.62 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2591  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4311  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
269 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3016  enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 
274 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3735  enoyl-CoA hydratase  47.39 
 
 
276 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1397  enoyl-CoA hydratase  45.78 
 
 
266 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
260 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
263 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  39.26 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  39.75 
 
 
261 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 
258 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
267 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
265 aa  142  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
256 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.78 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  37.14 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.91 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.78 
 
 
255 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
265 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.78 
 
 
255 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
262 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
263 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
258 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
261 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  30.33 
 
 
261 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
258 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 
260 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
264 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
265 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 
261 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 
254 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.41 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 
262 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.74 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 
294 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
255 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
259 aa  131  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  36.25 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.25 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.18 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  36.25 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09128  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01210)  36.36 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  35.86 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.25 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.18 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.18 
 
 
297 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
266 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  35.18 
 
 
261 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  35.18 
 
 
297 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 
271 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>