More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3185 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3185  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1370  enoyl-CoA hydratase  95.04 
 
 
262 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57851  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1984  enoyl-CoA hydratase  85.5 
 
 
262 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  79.39 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1316  enoyl-CoA hydratase  79.01 
 
 
263 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0712  enoyl-CoA hydratase  78.63 
 
 
263 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.518843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1803  enoyl-CoA hydratase  78.63 
 
 
263 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1325  enoyl-CoA hydratase  78.63 
 
 
263 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1463  enoyl-CoA hydratase  78.63 
 
 
263 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0439  enoyl-CoA hydratase  78.63 
 
 
263 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1156  enoyl-CoA hydratase  78.63 
 
 
263 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0739971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2144  enoyl-CoA hydratase  75.95 
 
 
263 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309295  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  74.81 
 
 
263 aa  357  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  74.81 
 
 
263 aa  357  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  74.81 
 
 
263 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2265  enoyl-CoA hydratase  75.19 
 
 
263 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1050  enoyl-CoA hydratase  73.28 
 
 
263 aa  349  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00724493  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5555  enoyl-CoA hydratase  74.43 
 
 
263 aa  338  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  60.69 
 
 
259 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  61.83 
 
 
259 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  58.02 
 
 
259 aa  295  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  57.63 
 
 
259 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  58.4 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
259 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1914  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
259 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.483428  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  55.56 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2631  enoyl-CoA hydratase  54.2 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0399422  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.03 
 
 
255 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.22 
 
 
255 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  47.35 
 
 
272 aa  198  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1949  enoyl-CoA hydratase  45 
 
 
257 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2591  enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
268 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  45 
 
 
273 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4311  enoyl-CoA hydratase  46.56 
 
 
269 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3016  enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 
274 aa  158  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
261 aa  158  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3735  enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 
276 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1397  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 
266 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
264 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  34 
 
 
263 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
254 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
254 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34 
 
 
263 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
265 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
260 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
259 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 
260 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
256 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
263 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 
264 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  29.8 
 
 
261 aa  133  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.82 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 
276 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
261 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.2 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.17 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
261 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.6 
 
 
263 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
259 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 
259 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  35.47 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.46 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.85 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.46 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.43 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09128  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01210)  34.43 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 
261 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
270 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
281 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 
282 aa  125  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
281 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>