More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2958 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1914  enoyl-CoA hydratase  81.08 
 
 
259 aa  391  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.483428  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2631  enoyl-CoA hydratase  70.93 
 
 
259 aa  325  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0399422  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  67.57 
 
 
259 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  59.07 
 
 
259 aa  309  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.24 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.04 
 
 
255 aa  300  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
259 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  59.46 
 
 
259 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
259 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  57.14 
 
 
259 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 
355 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3185  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
262 aa  271  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1370  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57851  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1984  enoyl-CoA hydratase  57.81 
 
 
262 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1316  enoyl-CoA hydratase  62.35 
 
 
263 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1803  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 
263 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1325  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 
263 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1463  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 
263 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1156  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 
263 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0739971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0712  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 
263 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.518843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0439  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 
263 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2144  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 
263 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309295  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2265  enoyl-CoA hydratase  60.32 
 
 
263 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1050  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 
263 aa  251  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00724493  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5555  enoyl-CoA hydratase  60.32 
 
 
263 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1949  enoyl-CoA hydratase  49.23 
 
 
257 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1397  enoyl-CoA hydratase  50.6 
 
 
266 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3016  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3735  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
276 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
261 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2591  enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 
268 aa  175  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4311  enoyl-CoA hydratase  49.6 
 
 
269 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  40.73 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  35.29 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
263 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
266 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
263 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
263 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
263 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
263 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
257 aa  148  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
261 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
258 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.14 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.28 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  36.63 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
262 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
262 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
260 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
262 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
259 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
280 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  32.79 
 
 
259 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
260 aa  142  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 
262 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
251 aa  142  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
264 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
256 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 
255 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.71 
 
 
255 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.46 
 
 
262 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
262 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
265 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.38 
 
 
266 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
260 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.32 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
265 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
261 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
257 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 
253 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.69 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
260 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.29 
 
 
257 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
261 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
263 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
270 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.048792  normal  0.959739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
263 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
263 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
263 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
263 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
263 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
260 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  35.98 
 
 
261 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
263 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
263 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2835  putative enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
261 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  35.98 
 
 
261 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>